Nicotinamide Dehydrogenase 2 (ND2)

 

          N2-N-732 Simon et al. 1994. Reads opposite of the coding strand, in the reverse direction.

          N2-J-748 Simon et al. 1994. Reads as the coding strand, in the forward direction.

          N2-J-1006 Simon et al. 1994. Reads as the coding strand, in the forward direction.

 

          Nicotinamide Dehydrogenase 3 (ND3)

 

          N3-J-5952 Simon et al. 1994. Reads as the coding strand, in the forward direction.

 

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N2-N-732 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T C A A T A G G G G G A T T A A A T C A A A C A T C T C T C C G A
N2-N-732 (rev) [primer-1] - - - - - - . . a . . t . . . . . c . . . . . t . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . . C . T T C T . C T A . . . . . T C . . A . A T A T . G A A .
ACARI Archegozetes longisetulosus A G . . C . . C A C A G A . . . . C A . . . A . G A C A . . A T .
ACARI Carios capensis . . . T . . . . . . . T . . C . . . . . G T T T . . C G . T . . .
ACARI Dinothrombium pandorae G T G . C C . C C C A . G C . . C C T C . . . . A A A A C . A A .
ACARI Haemaphysalis flava . . C . . T A T A A T T . . C . . . T T . . A . A T G T . A A A .
ACARI Ixodes hexagonus . . C C . . . . A . . . . . . . G A . . . . . . . . A T . . A A .
ACARI Leptotrombiium pallidum G T T T . T T T T C A . A . . . G G A C T T T C A A . T . G A A .
ACARI Ornithodoros moubata . . T . . T . . A . . T C . T . . . . . . T T T . . C A . T . . .
ACARI Platynothrus peltifer A G T . . G T C C C A . A . . . T A G T . . A . A G C A . A . A C
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . T . . C A T A . C . A . . . . A T . T . A . . T A A . T A A .
ACARI Varroa destructor G T . G . T A T A A T . . A T . . . . . . . A T . . . T . A . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp. . . T C . . . . A . . . . . T . . . . . . . A T A A . . . T A A .
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) C . G C . C . . A . . C C . . . . C . . . . . . A A C A . T A A G
ARANEAE Calisoga longitarsis G T G G . . . . A T C T . . T G G . . . . . G . G A C T . A . . T
ARANEAE Argiope bruennichi G . T T . G . . T T C T . . . . . . . . G . A . A G A G . A A A .
ARANEAE Habronattus oregonesis G T T T . T . . A T C T . . T . . . . . . . A T A A . A . T A A G
ARANEAE Haplopelma huwenum G T T G C . . . T T C . . A T G G A . . G C A G A T A G . T A . G
ARANEAE Heptathela hangzhouensis G G G C . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T A A . . . A A A .
ARANEAE Hypochilus thorelli A T G . . G . . T . C . A . . . . . A G . . G . A G A T . A A . G
ARANEAE Nephila clavata G . . T . T . . A T C . A . G . . . . . . . A G A G A T . G A A G
OPILIONES Chileogovea oedipus A . G G . . . . A . . . . A C C . . . . . . . T A A . T . A A T .
OPILIONES Phalangium opilio . . . T . . . . A . . . C . G T T . . . . . . . A G A A C A A . G
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi G . T . . C C T A . . . A C T . T C . . . . A . A A . A . T A T .
RICINULEI Cryptocellus centralis A G . . . T T C T . C T A . T . . . . . G . . T . . A . . T . . T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp A . . . . T A C A . . T A . T . C A . . . . G . A A . T . A A A .
SCORPIONES Buthus occitanus G . T T . T . . A . . . . . T . . . . . . G T T . . G T . A A A G
SCORPIONES Centruroides limpidus . . G T . G . . . . . G . . T . . . . . G C T T . . . T . G A . G
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis G . . G . . . . A . . G . . T G G C . . G T T T . . A . . A A A G
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus G . T T . T . . . . . T . . T . . . . . G G T G . . G T . G . . G
SCORPIONES Uroctonus mordax G . T . . T . . . . . . . . T G G C . . . . T C . . C A . T A A .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus A G . G . . A A T . C T . . . . . . . . . T . . . . A A . A . . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus C . . . . C T T A . . . . . T G G A A T T T T . A T . A . T A A .
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) C . . . . T C T A . . G . . T G G A A T T T T . A T . A . T A A .
UROPYGI Typopeltis sp . . . . . T T T A A T . . A T . . . A C C C T . . . A A . T A A .
PYCNOGONIDA Nymphon sp G . . G . G . . T A C T . . . G T A T C . G A T . . A G . T A A .
PYCNOGONIDA Endeis spinosa G . T T . . T . A . C . A . C . . C A C . . . . A A G A . T A A G
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare A G . . . T A T A . C T . A T . . . G . . . . T A T A A . T A A .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus G . . . . C . . . . . . . A T . . . . . . . T . C T A A C T . . .
MYRIAPODA Narceus annularis G . T . . T . C A . . C C . . . . . . . . . T . A T A . . T . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata G . . G . . . . A A . . . . . . . . . . . T . . . . C T . A . . T
MYRIAPODA Thyropygus sp. G . T . . . . . A . . C C . T . . C . . . C T C C T A T . A A A .
Drosophila yakuba G . . . . T . . A . . T . . . . . C . . . . . T . . A . . . . . .

N2-J-748 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus G G A T C A A T A G G G G G A T T A A A T C A A A C A T C T C T C
N2-J-748 (fwd) [primer-1] - - - - - - . . t . . a . . t . . . . . c . . . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . C . . . C . T T C T . C T A . . . . . T C . . A . A T A T . G
ACARI Archegozetes longisetulosus . . . A G . . C . . C A C A G A . . . . C A . . . A . G A C A . .
ACARI Carios capensis . . G . . . T . . . . . . . T . . C . . . . . G T T T . . C G . T
ACARI Dinothrombium pandorae . . . G T G . C C . C C C A . G C . . C C T C . . . . A A A A C .
ACARI Haemaphysalis flava A . C . . C . . T A T A A T T . . C . . . T T . . A . A T G T . A
ACARI Ixodes hexagonus . . . . . C C . . . . A . . . . . . . G A . . . . . . . . A T . .
ACARI Leptotrombiium pallidum . . . G T T T . T T T T C A . A . . . G G A C T T T C A A . T . G
ACARI Ornithodoros moubata . . . . . T . . T . . A . . T C . T . . . . . . T T T . . C A . T
ACARI Platynothrus peltifer . . . A G T . . G T C C C A . A . . . T A G T . . A . A G C A . A
ACARI Rhipicephalus sanguineus . C T . . T . . C A T A . C . A . . . . A T . T . A . . T A A . T
ACARI Varroa destructor . . G G T . G . T A T A A T . . A T . . . . . . . A T . . . T . A
AMBLYPYGI Phrynus sp . . G . . T C . . . . A . . . . . T . . . . . . . A T A A . . . T
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) . . . C . G C . C . . A . . C C . . . . C . . . . . . A A C A . T
ARANEAE Calisoga longitarsis . . T G T G G . . . . A T C T . . T G G . . . . . G . G A C T . A
ARANEAE Argiope bruennichi . . . G . T T . G . . T T C T . . . . . . . . G . A . A G A G . A
ARANEAE Habronattus oregonesis . . . G T T T . T . . A T C T . . T . . . . . . . A T A A . A . T
ARANEAE Haplopelma huwenum . . T G T T G C . . . T T C . . A T G G A . . G C A G A T A G . T
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . G G G C . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T A A . . . A
ARANEAE Hypochilus thorelli . . C A T G . . G . . T . C . A . . . . . A G . . G . A G A T . A
ARANEAE Nephila clavata . . G G . . T . T . . A T C . A . G . . . . . . . A G A G A T . G
OPILIONES Chileogovea oedipus . . T A . G G . . . . A . . . . A C C . . . . . . . T A A . T . A
OPILIONES Phalangium opilio . . G . . . T . . . . A . . . C . G T T . . . . . . . A G A A C A
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . . . G . T . . C C T A . . . A C T . T C . . . . A . A A . A . T
RICINULEI Cryptocellus centralis . . G A G . . . T T C T . C T A . T . . . . . G . . T . . A . . T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . A . . . . T A C A . . T A . T . C A . . . . G . A A . T . A
SCORPIONES Buthus occitanus . . T G . T T . T . . A . . . . . T . . . . . . G T T . . G T . A
SCORPIONES Centruroides limpidus . . T . . G T . G . . . . . G . . T . . . . . G C T T . . . T . G
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis . . . G . . G . . . . A . . G . . T G G C . . G T T T . . A . . A
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus . . G G . T T . T . . . . . T . . T . . . . . G G T G . . G T . G
SCORPIONES Uroctonus mordax . . . G . T . . T . . . . . . . . T G G C . . . . T C . . C A . T
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . T A G . G . . A A T . C T . . . . . . . . . T . . . . A A . A
UROPYGI Mastigoproctus giganteus T C C C . . . . C T T A . . . . . T G G A A T T T T . A T . A . T
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) T C C C . . . . T C T A . . G . . T G G A A T T T T . A T . A . T
UROPYGI Typopeltis sp T C T . . . . . T T T A A T . . A T . . . A C C C T . . . A A . T
PYCNOGONIDA Nymphon sp A . G G . . G . G . . T A C T . . . G T A T C . G A T . . A G . T
PYCNOGONIDA Endeis spinosa . . . G . T T . . T . A . C . A . C . . C A C . . . . A A G A . T
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare A . . A G . . . T A T A . C T . A T . . . G . . . . T A T A A . T
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . . G . . . . C . . . . . . . A T . . . . . . . T . C T A A C T
MYRIAPODA Narceus annularis . . . G . T . . T . C A . . C C . . . . . . . . . T . A T A . . T
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . . . G . . G . . . . A A . . . . . . . . . . . T . . . . C T . A
MYRIAPODA Thyropygus sp. . . . G . T . . . . . A . . C C . T . . C . . . C T C C T A T . A
Drosophila yakuba . . . G . . . . T . . A . . T . . . . . C . . . . . T . . A . . .

N2-J-1006 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C T T T C T C T A G G A G G A T T A C C C C C T T T T C T A G G T T T T T T A
N2-J-1006 (fwd) [Ind2] - - - - - - - . . . . t . . . c . . . . t . . a . . . t . . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum A . A . . A T . . A . . . . T A . G . . T . . . . . . A . . . . A . . . A C .
ACARI Archegozetes longisetulosus - - - A . . . . . . C G . . T A . . . . A . . G . C C A . C A C A . . . G . .
ACARI Carios capensis T . A A . A T . . . . . . . . A . . . . T . . . A C . T . . . . . . . . A . T
ACARI Dinothrombium pandorae - - - . . G T . . . C G . . G A . C . . . . . A C . A A . . . . G . . . G . C
ACARI Haemaphysalis flava A . A . . A T . G . . T . . . A . . . . A . . A . . A T . . . . C . . C G . .
ACARI Ixodes hexagonus T . A . . A T . . . . . . . C . . G . . T . . . . . . T . . . . A . . . C . .
ACARI Leptotrombiium pallidum - - - . . . . . T . C G . . . A . T . . T . . . C . . T . . . . A . . . . . T
ACARI Ornithodoros moubata T . A A . C T . . . . . . . . C . C . . A . . C A . A . . . . . A . . C . . T
ACARI Platynothrus peltifer G C . A G G . . G A . G . . . C . C . . T . . C A C G A C . . . A . . . C . .
ACARI Rhipicephalus sanguineus A . A . . . T . . . C T . . T A . . . . . . . A . . . A . T . . . . . . . . C
ACARI Varroa destructor T . A A G . T . . A . T . . . A . . . . T . . C . . . A . . . . A . . . A . T
AMBLYPYGI Phrynus sp - - - . . A T . . A . . . . G . . . . . . . . . C . C A C T . . A . . . . . C
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) - - - . . C . . G . . G . . G C . C . . T . . C C . G G C . . . C . . C . . T
ARANEAE Calisoga longitarsis - - - A A . T . G T C . . . G A . . . . . . . . . . . G . T . . G . . . . . T
ARANEAE Argiope bruennichi - - - A G A T . . . . . . . . A . . . . . . . A A . A T . G . . A . . C . A T
ARANEAE Habronattus oregonesis - - - A G A A . G . C G . . G A . G . . T . . . C . A T . G . . A . . . . A T
ARANEAE Haplopelma huwenum - - - A G A A . . . . . . . . A . T . . T . . . A . A . . T . . A . . . G . .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . T . . . . . A T . T . . C . . . C . .
ARANEAE Hypochilus thorelli - - - A A . A . T . . G . . G C . . . . T . . A A . A T . . . . G . . . . . C
ARANEAE Nephila clavata - - - A G G A . . . . T . . . . . . . . A . . A . . . T . . . . A . . . . . T
OPILIONES Chileogovea oedipus A . . . . A T . . A . . . . C . . T . . A . . . . . A T . . . . A . . . . . T
OPILIONES Phalangium opilio T . G A A . A . . . . G . . G A . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . C
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T . A . . A T . . A . . . . G . . C . . . . . A . . . T C T . . G . . . A . T
RICINULEI Cryptocellus centralis T . A . . A A . G . . . . . C C . . . . A . . A A C G . . . . . . . . . G C T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp T . A A A . . . T A . . . . . A . . . . A . . A A . A . . . . . . . . . C . T
SCORPIONES Buthus occitanus T . A A G . T . . . . . . . . . . T . . . . . C C . C . . . . . G . . . . . T
SCORPIONES Centruroides limpidus - - - A G C A . G . . . . . G . . T . . G . . . A . G . . T . . G . . . . . T
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis - - - . . A . . . . . G . . G . . . . . . . . G . . . T . . . . A . . . . . C
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus - - - A G A . . . . . . . . G . . T . . G . . . . . A T . . . . G . . . . . T
SCORPIONES Uroctonus mordax - - - . . . T . . . . . . . . A . . . . T . . . . . C . . C . . A . . . . . C
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus T . A . . A A . . . . . . . . . . T . . T . . . C . A T . T . . A . . . A . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus T . A A G A A . . . . . . . T C . C . . . . . A . . C T . . . . A . . . . . C
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) T . A A G A A . G . . . . . . C . C . . . . . A . . C T . . . . A . . . . . C
UROPYGI Typopeltis sp T . A A G . A . . . . T . . T A . . . . T . . . A . A . . T . . G . . . C . .
PYCNOGONIDA Nymphon sp T . A A A . T . . . . . . . . C . T . . T . . A A . A G C . . . G . . . G C T
PYCNOGONIDA Endeis spinosa T . A . . A T . G T T T . . G C . C . . . . . . . . A T C . . . A . . . G . .
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T . A . . A A . G . C . . . T C . T . . T . . . . . . T C G . . A . . . A . G
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . C . . C T . . . . . . . . A . C . . . . . C . . C T . . . . A . . . . . .
MYRIAPODA Narceus annularis . . C . . C . . C . . . . . . A . . . . . . . C . . C T C T . . A . . . A . C
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata A . A . . C T . . . . . . . . C . C . . . . . A . . . G . . . . A . . . A . .
MYRIAPODA Thyropygus sp. . . . . . G . . T . . . . . T C . T . . G . . . . . C T . . . . C . . C C . .
Drosophila yakuba T . A . . . T . . . . T . . . . . . . . T . . A . . . T . . . . A . . . . . .

N3-J-5952 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T T C C A T G A A T G A A A T C A A G G A G C A T T A G A G T G A
N3-J-5952 - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . t a t . . . . - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . A A T A . . . . . . . . A A . . . . . A T . A . T . . . . . G
ACARI Archegozetes longisetosus . . . T . C . . . . . . . . A A . . . . T A A . A . T . . A . . .
ACARI Carios capensis C . A T . . . . . . . . . . A A . T . . . A T . A . T C . A . . .
ACARI Dinothrombium pandorae A C . A C C . . . . . . G T A A . . . . . . G G A . C . . A . . .
ACARI Haemaphysalis flava G . T A T A . . . . . G . . A T T . . . . A T . A . T . . T . . .
ACARI Ixodes hexagonus A . . T . . . . . . . . . . C A . . . . . A T . . . . . . A . . G
ACARI Labidostomma sp . . G T T G . . G . . . G C . . . T . . G . T T . . G A T A . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum . . T . T . . . . . . G . . A T T T . . . T T . C . . . . A . . .
ACARI Ornithodoros moubata A . T T . . . . . . . . . . A A . T . . . A T . C . T A . A . . .
ACARI Platynothrus peltifer . . A T . C . . . . . . . . A A . G A . . A A . A . T . . T . . .
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . A T . C . . . . T T . . A T . T T C . A T . . . G . . T C . .
ACARI Varroa destructor . A T T T . . . . . . . . T A A . T . . G . . T . . . A . T . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp . . T T . . . . . . . . T . . T T . . . T T . C C . . A . T . . .
ARANEAE Calisoga longitarsis A . T T . . . . . . A T T . . A . T . . G . . T . . G T C C . . G
ARANEAE Habronattus oregonensis C . T T . . . . . . A T T G A T G T . . C T . . . . . . . T . . .
ARANEAE Haplopelma huwenum . . G T . . . . . . A T T T . A . T . . . . T C C . . . . . . ? ?
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . T T . . . . . . . . . . G A . T . . G A T T . . . A G A . . .
ARANEAE Hypochilus thorelli G . T T . . . . G A T . . G C T T T . . C A . C . . . A G A . . .
ARANEAE Nephila clavata A . T T . . . . . . A T T . . T . T . . T T . T . . . . . A . . .
OPILIONES Chileogovea oedipus . . T . . . . . . . . . G T . A T T . . . T . . . . . . . T . . G
OPILIONES Phalangium opilio C . T . . . . . . . . . . . A G . . . . G A G . . . . A . T . . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . A . T G A . . . . . G T C . T C T T C T T T . . . . A . A . . .
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . A T . . . . . . G . . A A G C A A C T G C C . C . . A . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . A T T . . . . . . . . . A A T C . . T T . . C . T T C A . . .
SCORPIONES Buthus occitanus . . T T T C . . . . . G G T A A . T . . T . . T . . G . . . . . .
SCORPIONES Centruroides limpidus . A T T T . . . G . . G . . A G . G . . C T . T C . T . . . . . G
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus . . T T T . . . G . . G T G G A . T . . . . . T C . T . . . . . G
SCORPIONES Uroctonus mordax . A T T T . . . . . . G G T A . . . . . T A . T . . . . . . . . G
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . A T . . C . . . . . . . . . A . . . . . A T T C . . A . T . . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . . T G A . . . . . . . . A G . . . . T . . . C . C A . A . . .
UROPYGI Typopeltis sp C . T T G A . . . . . . . T . . . . . . C T . . C . . A C A . . .
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . T T . . . . . . . . T . . A . T . . . . . . . . . . . A . . .
PYCNOGONIDA Nymphon sp . A T . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . T . . . A . T . . .
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . G T . . . . . . . . T T A A . T . . . . . . . . . . . . . . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius foricatus . A T T . . . . . . . . . . A A . . . . T . . . C . T . . C . . .
MYRIAPODA Narceus annularis A . . T . C . . . . . . . C . A . G . . . . . C C . . T C C . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . A . T . C . . . . . . G C . T . T . . . . . . C . T . . A . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp . A T T . C . . . . . . T C G A . C . . G . . . C . . A . T . . .
Drosophila yakuba . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A T . . . . A . T . . .