Home | Research | Publications | People | Courses
Arachnid Mitochondrial Primers | Arachnid Information | Spiders of Portland | PSU Invertebrate Museum

          

          Cytochrome b Apoenzyme (cytb)

 
          CB-J-10612 (alias CB1L). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          CB-J-10933 (alias CB1). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          CB-N-10920 (alias CB2-H). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          CB-J-11338 (alias CB3R-L). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          CB-N-11328 (alias CB3-H). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          CB-N-11367 (alias CB2). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          CB-J-11545 (alias CTBA). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

 
          Nicotinamide Dehydrogenase 1 (ND1)
 

          N1-N-11841 (alias CTBB). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          N1-N-12051 Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          N1-J-12248 (alias FawND1B). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          N1-J-12314 (alias FawND1A). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          N1-J-12533 Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          N1-J-12585 (alias ND1A). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          N1-N-12595 (alias ND1). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

 

      Click on links below to jump to alignment files of sequence data from each of the
      completed (or near complete) Chelicerate mt genomes we have evaluated.
 

CB-J-10612 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C C T T C A C C A T C A A A C A T T T C A T A T A T A T G A A A T T T C G G C
CB-J-10612 (fwd) [CB1L] - - - - - - . . . . . c . . . . . c . . . g c a t g . . . . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . .
ACARI Archegozetes longisetulosus . . A A . C . . . A G . T C A . . C . . . A C A . . . . . . . . C A . A . . A
ACARI Carios capensis . . . G . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . T . . G
ACARI Dinothrombium pandorae . . . A . C . . T . . T T C A . . C . . C . . C . . G . . . . . C A . A . . .
ACARI Haemaphysalis flava . . C A . . . . . . . . . . T . . . . . C . T . . . G . . . . . . . . T . . T
ACARI Ixodes hexagonus . . C A . C . . C . . T . . . . . C . . C C C C T . T . . . . . . A . A C . A
ACARI Labidostomma sp [part] . . . . . C . . T A G T T C T . . . . . T . . . . . . . . . . . . G G G . . T
ACARI Leptotrombdum pallidum . . A A . T . . T G T C T C A . . C . . C . . . T G . . . . . . . A . A . . A
ACARI Ornithodoros moubata . . A A . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . A
ACARI Platynothrus peltifer . . C A . . . . . A G T T C A . . C . . . . T C C . . . . . . . C A . A . . A
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . A A . T . . C . . T . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . C . . T . . T
ACARI Varroa destructor . . . A . T . . T . . . . . T . . . A A T . . . . . . . . . . . . . . T . . T
AMBLYPYGI Phrynus sp . . C . . C . . . . . T . . . . . C . . C . . . . . . . . . . . C . . T . . T
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Calisoga longitarsis . . A . T . . . T . . T . G A . . . . . G . . . G C . . . . . . . . . T . . .
ARANEAE Argiope bruennchi (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Habronattus oregonensis . . . . . T . . T . . T . G A T . A A G . . . . T . T . . . . . . . . T . . A
ARANEAE Haplopelma huwenum . . . . . T . . . . . T T C T T . G A G . . . . . . G . . G . . . . . T . . T
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . C A . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . T
ARANEAE Hypochilus thorell . . A . . T . . G . . T . G A T . A A G C . . . T . . . . . . . . . . T . . T
ARANEAE Nephila clavata . . C . . T . . T . . . . G A T . A A . T . . . T . T . . . . . . . A T . . A
OPILIONES Chileogovea oedipus . . A A . T . . T . . T . . T . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . T . . T
OPILIONES Phalangium opilio . . A G . . . . T . . . . . T . . . . . T . . . T G . . . . . . . . . T . . G
PALPIGRADI Prokonenia wheeleri . . A . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . A
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp . . . A . T . . T A G . . . T . . . . . C . T . . A T . . . . . . . . T . . T
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . . C A . C . . C . T . . . . . . C A G . . T . T G . . . . . C A A A T . . A
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . . . . C . . T . . T . . C . . . . . . T G . . . . . . . G . A . . T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . A A . . . . C A A C C C . . . C A A T A T . T G . . . . . . . A . A . . T
SCORPIONES Buthus occitanus . . . . . T . . T G T C . . T . . . . . T . . . T . C . . . . . . . . T . . G
SCORPIONES Centrurodes limpidus . . . . . T . . . G G . . . T . . . . . T . . . T . C . . . . . C . . T . . T
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus . . C . . . . . T . . . . G A . . . . . T . . . T . C . . . . . . . . T . . .
SCORPIONES Uroctonus mordax . . . . . T . . T . . T . . T . . . . . T . . . T . T . . . . . . . . A . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . C A . T . . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . C . . . . . . . . T . . . . . C . . T C T A . . . . . . . G A . G A . . A
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
UROPYGI Typopeltis sp . . C . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . G A . . .
Outgroups: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . C A . C . . T . T . . G A . . . . . . . . C C . G . . . . . . . . T . . A
MYRIAPODA Narceus annularis . . . A G C . . . . . C . . . . . . . . T . . C C . G . . . . . C A . G . . T
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . . A . G T . . . . . . . . T . . A . . . G C A T G . . . . . . C . . T . . A
MYRIAPODA Thyropygus sp . . C A G C . . . A G . . . T . . . . . . . T A . . . . . . . . . A . A . . A
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . A . G C . . T A G C . . T . . . A A C A G A . . . . . . . G A . . T . . A
PYCNOGONIDA Colossendeis sp . . . . G T . . T A G G . . T C . . A G . A C . . . . . . G . G G . . T . . T
PYCNOGONIDA Endeis spinosa ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . . G . T . . T . . . . . T . . . A A T G T . . . . . . . . G . . . T . . G
Reference Genome: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . . A G . T . . . A T T . . T . . . . . . A G A T G . . . . . . . . . T . . A

CB-J-10933 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C T A G G C T A T G T C C T C C C A T G A G G A C A A A T A T C C T T C T G A
CB-J-10933 (fwd) [CB1] - - - - - - . . . . . a . . a . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum T . . . . A . . . A . T T . A . . C . . . . . G . . . . . . . . A . . T . . .
ACARI Archegozetes longisetulosus . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . G . . . . . .
ACARI Carios capensis T . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . .
ACARI Dinothrombium pandorae A . . . . T . . C . . T . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . T . . .
ACARI Haemaphysalis flava T . . . . T . . . A . T . . A . . G . . . . . C . . . . . G . . A . . . . . .
ACARI Ixodes hexagonus T . . . . A . . . . . T . . T . . T . . G . . G . . . . . . . . T . . . . . G
ACARI Labidostoma sp [part] . . T . . T . . . . . T T . G . . T . . . . . C . . . . . . . . T . . T . . G
ACARI Leptotrombdum pallidum T . . . . A . . . . . T T . G . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . .
ACARI Ornithodoros moubata T . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
ACARI Platynothrus peltifer T . T . . G . . C . . A . . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G
ACARI Rhipicephalus sanguineus T . . . . G . . . A . T T . A . . T . . G . . C . . . . . . . . A . . T . . .
ACARI Varroa destructor A . . . . G . . C . . T T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp. . . . . . T . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Calisoga longitarsis T . . . . T . . . . . A . . T . . T . . G . . T . . . . . . . . T . . T . . G
ARANEAE Argiope bruennchi ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Habronattus oregonensis T . . . . A . . . . . A T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . G . . T . . G
ARANEAE Haplopelma huwenum T . G . . T . . C . . A T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . T . . G
ARANEAE Hypochilus thorell T . . . . T . . . . . G T . G . . T . . . . . G . . . . . G . . T . . T . . G
ARANEAE Nephila clavata T . . . . A . . . . . T T . G . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . .
OPILIONES Chileogovea oedipus . . . . . A . . . . . . T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . .
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . T . . . . . G T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G
PALPIGRADI Prokonenia wheeleri T . G . . T . . . . . G T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . .
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp T . . . . G . . . . . T T . A . . T . . . . . T . . G . . . A G A . . T . . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . .
RICINULEI Cryptocellus centralis T . . . . T . . C . . T . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A T . . .
SCORPIONES Buthus occitanus T . . . . T . . . . . G T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . T . . T . . .
SCORPIONES Centrurodes limpidus T . G . . G . . . . . T T . A . . . . . . . . G . . G . . G . . T . . T . . G
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus T . G . . T . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . . . . G . . T . . T . . .
SCORPIONES Uroctonus mordax T . . . . T . . . . . A T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . A . . T . . .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . . . . . . C . . T T . A . . . . . . . . T . . . . . G . . A . . T . . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus T . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A T . . G
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
UROPYGI Typopeltis sp T . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . . . . G . . T . A T . . .
Outgroups: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus G . T . . G . . . . . A T . A . . C . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . .
MYRIAPODA Narceus annularis T . . . . . . . C . . T T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata G . . . . G . . . . . T T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp T . . . . A . . . . . G T . A . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi A . . . . A . . . . . A . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
PYCNOGONIDA Colossendeis sp A . . . . T . . . . . G T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . .
PYCNOGONIDA Endeis spinosa ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare A . . . . T . . . . . T T . A . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . T . . .
Reference Genome: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba A . . . . T . . . . . T T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . .

CB-N-10920 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C T C C C A T G A G G A C A A A T A T C C T T C T G A G G A G C A A C A
CB-N-10920 (rev) [CB2-H] - - - - - - . . . . . . . . . . . . . . a . . . . . . . . g - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum T . A . . C . . . . . G . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . T . . .
ACARI Archegozetes longisetulosus . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . G . . . . . . . . G . . T . . .
ACARI Carios capensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . T . . .
ACARI Dinothrombium pandorae . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . T . . . . . G . . C . . .
ACARI Haemaphysalis flava . . A . . G . . . . . C . . . . . G . . A . . . . . . . . G . . T . . .
ACARI Ixodes hexagonus . . T . . T . . G . . G . . . . . . . . T . . . . . G . . T . . . . . .
ACARI Labidostoma sp [part] T . G . . T . . . . . C . . . . . . . . T . . T . . G . . G . . T . . .
ACARI Leptotrombdum pallidum T . G . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . T . . . . . .
ACARI Ornithodoros moubata . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
ACARI Platynothrus peltifer . . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C . . .
ACARI Rhipicephalus sanguineus T . A . . T . . G . . C . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . T . . T
ACARI Varroa destructor T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . G . . T . . G
AMBLYPYGI Phrynus sp. . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Calisoga longitarsis . . T . . T . . G . . T . . . . . . . . T . . T . . G . C T . . . . . T
ARANEAE Argiope bruennchi ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Habronattus oregonensis T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . G . . T . . G . C T . . T . . T
ARANEAE Haplopelma huwenum T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . C . . . T . . T
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . T . . G . C T . . T . . .
ARANEAE Hypochilus thorell T . G . . T . . . . . G . . . . . G . . T . . T . . G . C T . . . . . T
ARANEAE Nephila clavata T . G . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C T . . T . . G
OPILIONES Chileogovea oedipus T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . T
OPILIONES Phalangium opilio T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . G . . C . . .
PALPIGRADI Prokonenia wheeleri T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . T . . T
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp T . A . . T . . . . . T . . G . . . A G A . . T . . . . . . . . . . . T
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . T . . . . . .
RICINULEI Cryptocellus centralis . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A T . . . . . . A . . . . .
SCORPIONES Buthus occitanus T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . T . . T . . . . . G . . T . . T
SCORPIONES Centrurodes limpidus T . A . . . . . . . . G . . G . . G . . T . . T . . G . . G . . . . . T
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus . . T . . . . . . . . T . . . . . G . . T . . T . . . . . . . . T . . T
SCORPIONES Uroctonus mordax T . A . . T . . . . . T . . . . . . . . A . . T . . . . . G . . T . . T
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus T . A . . . . . . . . T . . . . . G . . A . . T . . . . . G . . C . . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A T . . G . . . . . T . . .
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
UROPYGI Typopeltis sp . . T . . . . . . . . T . . . . . G . . T . A T . . . . . T . . T . . .
Outgroups: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus T . A . . C . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
MYRIAPODA Narceus annularis T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . C . . C
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp T . A . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . T G . .
PYCNOGONIDA Colossendeis sp T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . G . C
PYCNOGONIDA Endeis spinosa ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T . A . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . T . . . . . . . . . G . .
Reference Genome: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba T . A . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . T

CB-J-11338 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C C A A T T C A T A T T C A A C C A G A A T G A T A C T T C T T A T T T
CB-J-11338 (fwd) [CB3R-L] - - - - - - . . . . . . a . . . . c . . . . . . . . Y . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . C C C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . T C . T . . .
ACARI Archegozetes longisetulosus . . . . . C . . C . . C . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . C
ACARI Carios capensis . . T C C . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . .
ACARI Dinothrombium pandorae . . . G . G . . C . . C . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . C
ACARI Haemaphysalis flava . . . C C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . .
ACARI Ixodes hexagonus . . T C C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . C
ACARI Labidostoma sp . . T C C G . . . . . . . . G . . ? . . . . . . . . . . . . C . . . . C
ACARI Leptotrombdum pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . T . . T . . . . . .
ACARI Ornithodoros moubata . . C C C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
ACARI Platynothrus peltifer . . . G . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . C C C C . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . .
ACARI Varroa destructor . . T C C G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . T C . C . . C
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Calisoga longitarsis . . T G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . T . . G . . .
ARANEAE Argiope bruennchi ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Habronattus oregonensis . . T G . . . . . . . . . . G . . T . . G . . . . . T . . T . . . . . .
ARANEAE Haplopelma huwenum . . G G . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . T . . T C . G . . .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . T C . . . . .
ARANEAE Hypochilus thorell . . T . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . G . . . . . T . . . . . .
ARANEAE Nephila clavata . . G . . . . . . . . . . . G . . G . . G . . G . . T . . T . . . . . .
OPILIONES Chileogovea oedipus . . T . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T C . . . . .
OPILIONES Phalangium opilio . . T T . A . . . . . C . . . . . W . . . . . . . . . . . . C . . . . C
PALPIGRADI Prokonenia wheeleri . . T C . . . . . . . . . . . . . W . . . . . . . . . . . . ? ? ? ? ? ?
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . G . . . . . . C . . . . C
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . . C . C C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T C . T . . .
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T C . . . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . C G . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . T C . G . . C
SCORPIONES Buthus occitanus . . T G . G . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . T . . T C . T . . .
SCORPIONES Centrurodes limpidus . . T G . . . . C . . . . . G . . . . . G . . G . . . . . T C . T . . .
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus . . . G . C . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . T . . T C . . . . .
SCORPIONES Uroctonus mordax . . T G . A . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . T . . T C . C . . .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . W . . C
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . T . C C . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . Y . . Y C . . . . .
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
UROPYGI Typopeltis sp . . T . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . .
Outgroups: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . T C . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
MYRIAPODA Narceus annularis . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . G . . . . . T . . T C . . . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . . . . . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . G . A . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . C . . . . C
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . T . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . T . . . . . .
PYCNOGONIDA Colossendeis sp . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . G . . T . . T . . G . . .
PYCNOGONIDA Endeis spinosa ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
Reference Genome: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . . . G C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . .

CB-N-11328 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C A A C C A G A A T G A T A C T T C T T A T T T G C A T A T G C C
CB-N-11328 (rev) [CB3-H] - - - - - - . . . . . . . . Y . . . c . . . . . . . c - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . . . . T . . . . . . . . T . . T C . T . . . . . T . . . . . .
ACARI Archegozetes longisetulosus . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . C . . A
ACARI Carios capensis . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . A
ACARI Dinothrombium pandorae . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . C . . T . . C . . A
ACARI Haemaphysalis flava . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . T . . . . . A
ACARI Ixodes hexagonus . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . C . . . . . . . . A
ACARI Labidostoma sp (partial) . . G . . ? . . . . . . . . . . . . C . . . . C . . N . . C . . A
ACARI Leptotrombdum pallidum . . . . . T . . G . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . . . . A
ACARI Ornithodoros moubata . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . A
ACARI Platynothrus peltifer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . . C . . .
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . G . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . C . . A
ACARI Varroa destructor . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . A
AMBLYPYGI Phrynus sp. . . . . . T . . . . . . . . T . . T C . C . . C . . C . . C . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Calisoga longitarsis . . . . . T . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . T . . . A . A
ARANEAE Argiope bruennchi ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Habronattus oregonensis . . G . . T . . G . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . . A . T
ARANEAE Haplopelma huwenum . . . . . T . . G . . . . . T . . T C . G . . . . . G . . . . . T
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . . . . . . . . . T . . T C . . . . . . . T . . . . . T
ARANEAE Hypochilus thorell . . G . . T . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . T
ARANEAE Nephila clavata . . G . . G . . G . . G . . T . . T . . . . . . . . T . . . A . T
OPILIONES Chileogovea oedipus . . . . . T . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . T . . . . . A
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . W . . . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . C . . A
PALPIGRADI Prokonenia wheeleri (partial) . . . . . W . . . . . . . . . . . . ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp . . . . . T . . G . . G . . . . . . C . . . . C . . . . . C ? ? ?
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A . . . . . . . . . . . . . . . . T C . T . . . T . T . . . . . .
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . . . . . . . . . . T . . T C . . . . . . . . . . C . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . . G . . G . . . . . . . . T C . G . . C . . T . . . A . T
SCORPIONES Buthus occitanus . . . . . G . . G . . . . . T . . T C . T . . . . . T . . . . . A
SCORPIONES Centrurodes limpidus . . G . . . . . G . . G . . . . . T C . T . . . . . C . . . . . T
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus . . G . . T . . . . . . . . T . . T C . . . . . . . T . . . . . A
SCORPIONES Uroctonus mordax . . G . . T . . . . . . . . T . . T C . C . . . . . T . . . . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . W . . C . . . . . C . . A
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . . . . . . . . . . . . . Y . . Y C . . . . . . . T . . C T . .
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
UROPYGI Typopeltis sp . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . C T . .
Outgroups: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T
MYRIAPODA Narceus annularis . . . . . . . . G . . . . . T . . T C . . . . . . . . . . C . . A
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . T . . . . . . . . T . . . C . . . . C . . . . . . . . A
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . . . . T . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . . . . T
PYCNOGONIDA Colossendeis sp . . . . . T . . G . . G . . T . . T . . G . . . . . . . . . . . T
PYCNOGONIDA Endeis spinosa ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . A
Reference Genome: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . C . . A

CB-N-11367 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C G A T C A A T C C C T A A C A A A T T A G G G G G A G T A A T T G C A C T T
CB-N-11367 (rev) [CB2] - - - - - - . . t . . . . . t . . . . . . . . a . . . . . . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . T . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . A
ACARI Archegozetes longisetulosus . . . . . G . . T . . C T C A . . . C . . . . A . . . . . G G . A . . . . . A
ACARI Carios capensis . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A
ACARI Dinothrombium pandorae . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C T . A . . C T . A
ACARI Haemaphysalis flava . . T . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . A . . G . . . . . . . . T . . C
ACARI Ixodes hexagonus . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T T . A
ACARI Labidostoma sp (partial) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ACARI Leptotrombdum pallidum . . . . . T . . T . . . . . T . . . . . . . . A . . G . . G . . . . . C T . A
ACARI Ornithodoros moubata . . C . . . . . T . . . . . T . . . C . T . . . . . T . . G . . A . . . . . A
ACARI Platynothrus peltifer . . . . . C . . . . . A T C A . . G C . . . . . . . G . . T G . A . . T . . C
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . . . . . . T . . C . . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . . . T . . A
ACARI Varroa destructor . . T . . T . . T . . . . . T . . G . . . . . T . . G . . . . . . . G T T . A
AMBLYPYGI Phrynus sp . . T A G . . . . . . A . . T . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . C . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Calisoga longitarsis . . G . . T . A T G . A . G A . . . A . G . . . . . . . . T G . G . . T T . A
ARANEAE Argiope bruennchi ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
ARANEAE Habronattus oregonensis . . T . . T . . T . . . . G A . . G A . T . . . . . G . . G . . . . . T T . A
ARANEAE Haplopelma huwenum . . T . . . . . T . . . . G A . . G A . T . . T . . T . . T G . . . . T T . A
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . C . . . . . . . . A . . T . . . A . . . . A . . . . . C G . A . . . T . A
ARANEAE Hypochilus thorell . . . . . . G . T . . . . . T . . G A . T . . T . . T . . G G . . . . T T . A
ARANEAE Nephila clavata . . T . . T . . T T . A . G T . . . A . T . . . . . G . . T G . A . . T T . A
OPILIONES Chileogovea oedipus . . T . . T . . T . . A . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . A
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . T . . T . . . . . T . . . C . . . . A . . T . . C T . A . . C T . A
PALPIGRADI Prokonenia wheeleri (partial) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . . C A G T . . T G . . . . . . . . A . T . . . . . G . . T C . . . . C . . .
RICINULEI Cryptocellus centralis . . C . . . . . . . . A . . . . . . C . T . . T . . . . . T G . . . . T A . A
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . . . G . T . . A . . T . . . . . T . . A . . T . . . . . A . . C . . .
SCORPIONES Buthus occitanus . . . . . . . . T . . A . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T T . A
SCORPIONES Centrurodes limpidus . . T . . T . . T . . . . . T . . G . . G . . . . . . . . . T . A . . T T . A
SCORPIONES Euscorpius flavicaudis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus . . T . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T T . A
SCORPIONES Uroctonus mordax . . T . . T . . T . . A . G A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . G
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . . . . . . . . . A . . T . . . C . T . . A . . . . . . . . . . . C . . A
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . G . . T . . T . . . . . T . . . C . G . . A . . . . . C . . . . . C T . A
UROPYGI Mastigoproctus (Hassanin et al) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
UROPYGI Typopeltis sp . . . G . . . . T . . A . . T . . . C . T . . A . . T . . . . . A . . T . . A
Outgroups: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . C . . . . . T . . . G . T . . G C . . . . . . . . . . C C . G . . C . . G
MYRIAPODA Narceus annularis . . . . . . . . . . . C . . . . . G C . . . . A . . . C . C G . . . . T T . A
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . . T . . C . . T . . C . . T . . . . . . . . A . . . . . C . . C . . C T . A
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . . . . T . . . . . T . . . C . . . . T . . . . . . G C C . . C . . A
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . . . . C . . T . . . . . T . .