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          Nicotinamide Dehydrogenase 4 (ND4)

 

          N4-N-8484 Simon et al. 1994. Reads as the coding strand, in the forward direction.

          N4-J-8502 (alias ND4R2). Simon et al. 1994. Reads opposite of the coding strand, in the reverse direction.

          N4-N-8718 (alias ND4F3). Simon et al. 1994.Reads as the coding strand, in the forward direction.

          N4-J-8944 (alias ND4). Simon et al. 1994. Reads opposite of the coding strand, in the reverse direction.

 

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N4-N-8484 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T G T G T G T T T A A T A T G G C G G C T C C T C C T T C A A T A
N4-N-8484 (fwd) - - - - - - g c . . . . . . a . . a . . . . . . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum A . A A . T G C . . . . . . A T . A . . . . . C A T A A . T T . .
ACARI Archegozedes longisetulosus . . . . . T . . G . . . . . . . G A . T . . . C . . A . . C T . G
ACARI Carios capensis A . A A G A G . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . T . . G
ACARI Dinothrombium pandorae . . C A . T . . . . G A . . T T . C T T C . . . . . G . . . T . G
ACARI Haemaphysalis flava . C A A . T G . . . . . . . A T . A . . C . . . A T A A . T . . G
ACARI Ixodes hexagonus . C A A . T G . G . . . . . A T . T . . A . . . . . . A . G . . .
ACARI Labidostoma sp A . G A . A A . G . . . . . A . . C T . C . . C . . C . . C T . .
ACARI Leptotrombidium pallidum . C G . C T A . . . G A . . A . G T C T . . . . . . . . . . T . .
ACARI Ornithodoros moubata A . A . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G
ACARI Platynothrus peltifer A . G . C T A G C . . . . . . . G . . T G . . C . . . A . T T . .
ACARI Rhipicephalus sanguineus A . A A . T A . . . . . . . A T . A . . G . . A A T A A . T . . .
ACARI Varroa destructor . . . . . T A . . . . . C . T . G A T . C . . . . . A A . . . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp A . A A C . A . A . . . . . . . . T . . . . . . . . A G G . . . T
ARANEAE Calisoga longitarsis . C C A . T . . A . . C T . A T . A . . A . . C . . A . . C . . T
ARANEAE Heptathela hangzhouensis A . . T C T A . C . . C . . A T . . . . . . . . . . A . . T T . .
ARANEAE Haplopelma huwenum . T A . C C A . C . . C T . T T . A . . C . . . . . . . . . T . T
ARANEAE Habronattus oregonensis A T A . C A C . A . . . . . C T . A . . . . . C . . C A . . . . C
ARANEAE Nephila clavata A T . . C C . C . . . . . . T . . T . . . . . C . . C . . . . . T
ARANEAE Hypochilus thorelli C T . A . A A . A . . . . . A T . A A T C . . C . . C . . T . . T
OPILIONES Chileogovea oedipus . T A . C A A G A . . . . . A . . A A T A . . A . . A A . T T . .
OPILIONES Phalangium opilio A . . . . . A G A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T T C . .
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp A . A T . T . . A . . . . . A T . . T . C . . A . . . . . C T . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A T . A . T G G A . . . T . T T . C A G C . . C . . . . . . C . .
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . A . T . G . . . . . . A T . T . . . . . . . . A . . T T . T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . T . A A . G . . . T . T . . T T T . . . C . . . . T T C . T
SCORPIONES Buthus occidentalis A . A A C A A A C . . . . . A . . C . . C . . . . . C . . C . . .
SCORPIONES Centruroides limpidus A . A . C T A A . . . C . . A . . A . . C . . . . . . . . T . . .
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus A C . T C A A A . . . . . . A . . C . T . . . . . . . . . . . . .
SCORPIONES Uroctonus mordax A . A . . T A A . . . . . . A . . T . . . . . . . . C . . . . . .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus A . A A . A G G . . . C . . . . . T A G . . . . . . A A . . . . T
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . . . . A . . . . . . T . T . G . . . C . . . . . . . . . . . T
UROPYGI Typopeltis sp . T A . . T . . C . . . T . T . G . . . A . . . . . A . . T G . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . . . . T A G A . . . . . . . . T . . C . . C . . A A G C T . .
MYRIAPODA Narceus annularis . T G A G C G C . . . . . . . . . A . . G . . . . . . A . T . . T
MYRIAPODA Scutigera coleopterata . . . . . . A G A . . . . . A . . . . . . . . . . . . A G . . . G
MYRIAPODA Thyropygus sp G T A A G A . C . . . . . . A . . T . . . . . . A T A . . T T . G
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi A T . A . T . G . . . . . . A . . T . . A . . C . . C . . . . . .
PYCNOGONIDA Nymphon sp A C . A . A . . A . . . . . A T . A . . A . . C . . C . . T C . .
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . T A . C A A . . . . . . . C T . T . T . . . . . . A . . T . . .
Drosophila yakuba A . A T C A G C . . . . . . A . . A . . . . . . . . A A . G T . .

N4-J-8502 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T G T G T G T T T A A T A T G G C G G C T C C T C C T T C A A T A A A T
N4-J-8502 (rev) [ND4R2] - - - - - - - c . . . . . . a . . a . . . . . . . . . a . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum A . A A . T G C . . . . . . A T . A . . . . . C A T A A . T T . . . . C
ACARI Archegozetes longisetulosus . . . . . T . . G . . . . . . . G A . T . . . C . . A . . C T . G T C .
ACARI Carios capensis A . A A G A G . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . T . . G . . .
ACARI Dinothrombium pandorae . . C A . T . . . . G A . . T T . C T T C . . . . . G . . . T . G G G G
ACARI Haemaphysalis flava . C A A . T G . . . . . . . A T . A . . C . . . A T A A . T . . G . . .
ACARI Ixodes hexagonus . C A A . T G . G . . . . . A T . T . . A . . . . . . A . G . . . . . .
ACARI Labidostomma sp A . G A . A A . G . . . . . A . . C T . C . . C . . C . . C T . . . C .
ACARI Leptotrombidium pallidum . C G . C T A . . . G A . . A . G T C T . . . . . . . . . . T . . . . .
ACARI Ornithodoros moubata A . A . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . .
ACARI Platynothrus peltifer A . G . C T A G C . . . . . . . G . . T G . . C . . . A . T T . . T C .
ACARI Rhipicephalus sanguineus A . A A . T A . . . . . . . A T . A . . G . . A A T A A . T . . . . . .
ACARI Varroa destructor . . . . . T A . . . . . C . T . G A T . C . . . . . A A . . . . . . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp. A . A A C . A . A . . . . . . . . T . . . . . . . . A G G . . . T . . .
ARANEAE Calisoga longitarsis . C C A . T . . A . . C T . A T . A . . A . . C . . A . . C . . T . . C
ARANEAE Heptathela hangzhouensis A . . T C T A . C . . C . . A T . . . . . . . . . . A . . T T . . . . C
ARANEAE Haplopelma huwenum . T A . C C A . C . . C T . T T . A . . C . . . . . . . . . T . T . . .
ARANEAE Habronattus oregonensis A T A . C A C . A . . . . . C T . A . . . . . C . . C A . . . . C . . .
ARANEAE Nephila clavata A T . . C C . C . . . . . . T . . T . . . . . C . . C . . . . . T . . C
ARANEAE Hypochilus thorelli C T . A . A A . A . . . . . A T . A A T C . . C . . C . . T . . T . . .
OPILIONES Chileogovea oedipus . T A . C A A G A . . . . . A . . A A T A . . A . . A A . T T . . . . .
OPILIONES Phalangium opilio A . . . . . A G A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T T C . . . . .
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp A . A T . T . . A . . . . . A T . . T . C . . A . . . . . C T . . . . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A T . A . T G G A . . . T . T T . C A G C . . C . . . . . . C . . G G G
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . A . T . G . . . . . . A T . T . . . . . . . . A . . T T . T G G .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . T . A A . G . . . T . T . . T T T . . . C . . . . T T C . T . G A
SCORPIONES Buthus occidentalis A . A A C A A A C . . . . . A . . C . . C . . . . . C . . C . . . . . C
SCORPIONES Centruroides limpidus A . A . C T A A . . . C . . A . . A . . C . . . . . . . . T . . . . . C
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus A C . T C A A A . . . . . . A . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . C
SCORPIONES Uroctonus mordax A . A . . T A A . . . . . . A . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . C
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus A . A A . A G G . . . C . . . . . T A G . . . . . . A A . . . . T . . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . . . . A . . . . . . T . T . G . . . C . . . . . . . . . . . T . . .
UROPYGI Typopeltis sp . T A . . T . . C . . . T . T . G . . . A . . . . . A . . T G . . . . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . . . . T A G A . . . . . . . . T . . C . . C . . A A G C T . . . . .
MYRIAPODA Narceus annularis . T G A G C G C . . . . . . . . . A . . G . . . . . . A . T . . T . . .
MYRIAPODA Scutigera coleopterata . . . . . . A G A . . . . . A . . . . . . . . . . . . A G . . . G . . C
MYRIAPODA Thyropygus sp G T A A G A . C . . . . . . A . . T . . . . . . A T A . . T T . G . . .
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi A T . A . T . G . . . . . . A . . T . . A . . C . . C . . . . . . . . .
PYCNOGONIDA Nymphon sp A C . A . A . . A . . . . . A T . A . . A . . C . . C . . T C . . . G .
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . T A . C A A . . . . . . . C T . T . T . . . . . . A . . T . . . . . .
Drosophila yakuba A . A T C A G C . . . . . . A . . A . . . . . . . . A A . G T . . . . .

N4-N-8718 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T T A A T T G C T T A T T C T T C T G T T G G T C A T A T G G G A
N4-N-8718 (fwd) [ND4F3] - - - - - - . . . . . . . . a . . g . . . . c . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . T
ACARI Archegozedes longisetulosus . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . C . . A . . T
ACARI Carios capensis . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . T
ACARI Dinothrombium pandorae . . G G . . . . C . T . A T A . . A . . G T C G . . . . . . . . T
ACARI Haemaphysalis flava . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . C . . A . . .
ACARI Ixodes hexagonus . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A T . C . . . . . A . . .
ACARI Labidostoma sp . . . G . A . . . . T C . . . . . A . . A . C C . . . . . A . . G
ACARI Leptotrombidium pallidum C . T G . A . . . . . . A T G . . . A . . . C . . . . . . A . . .
ACARI Ornithodoros moubata . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . G T . . . . . . . A . . .
ACARI Platynothrus peltifer . . T G . G . . . . . . . . . . . C . . . T . C . . C . . . . . T
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . A T C . . . . . . A . . .
ACARI Varroa destructor . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . C T . . . . . . . A A . T
AMBLYPYGI Phrynus sp. . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . A . C . . . . . . A . . C
ARANEAE Calisoga longitarsis . . . G . A . . A . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . A . . C
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . .
ARANEAE Haplopelma huwenum . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . A . C A . . . . . A . . T
ARANEAE Habronattus oregonensis C . . . . . . . C . . C . . C . . . . . A . C . . . . . . A . . T
ARANEAE Nephila clavata . . . . . . . . A . . C . . . . . A . . A . C . . . . . . A . . .
ARANEAE Hypochilus thorelli C . T . . C . . C . . C . . A . . . . . A T C G . . . . . A . C C
OPILIONES Chileogovea oedipus . . . G . A . . A . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . A . . .
OPILIONES Phalangium opilio . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . A . . G . . . . . A A . T
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp . . . G . A . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . A A . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . A . C . . . . . A . . G
RICINULEI Cryptocellus centralis . . G G . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . T C .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . G . . . . . . . C . . . . . . . . G . C . . . . . . . . . T
SCORPIONES Buthus occidentalis . . . G . A . . . . . C . . . . . A . . C T . C . . . . . A A . C
SCORPIONES Centruroides limpidus C . . G . G . . C . . C . . C . . C . . . T . . . . C . . A A . C
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus C . T G . A . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . A A . .
SCORPIONES Uroctonus mordax . . . G . A . . . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A A . . . . . . . . . . .
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . A . . G
UROPYGI Typopeltis sp C . T . . . . . . . . . . . A . . A . . A T C . . . . . . A . . G
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . . . . . . . C . . C . . . . . A . . G . T . . . . . . A . . .
MYRIAPODA Narceus annularis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . T
MYRIAPODA Scutigera coleopterata . . . . . . . . A . . C . . . . . G . . . . C . . . . . . A . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T A . . . . . A . . C
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . T . . . . . A . . C . . A . . G A . . T C . . . . . . A . . .
PYCNOGONIDA Nymphon sp C . T . . . . . . . . C . . A . . A . . C T C . . . . . . A . . C
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . . G . A . . . . . C . . . . . A . . . . T . . . . . . A . . G
Drosophila yakuba . . . . . . . . A . . . . . A . . A . . . . C . . . . . . A . . .

N4-J-8944 (back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T T A C C A A A G G C T C A T G T G G A G G C T C C T A T T G C A
N4-J-8944 (rev) [ND4] - - - - - - . . a . . . . . . . . t . . a . . . . . - - - - - - -
ACARI Amblyomma triguttatum C . T . . T . . . . . . . . . . . A . . A . . G . . . . . . . . T
ACARI Archegozedes longisetulosus . . G . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . T
ACARI Carios capensis C . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . T
ACARI Dinothrombium pandorae C . C . . . . G . . . . . . . . . A . . A . . . . . . C . . C . T
ACARI Haemaphysalis flava C . C . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . C . . A . . . T . .
ACARI Ixodes hexagonus C . T . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . T . .
ACARI Labidostoma sp C . T . . C . . A . . C . . . . . A . . A . . C . . . C . A . T T
ACARI Leptotrombidium pallidum C . C . . . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . . . T . A C A .
ACARI Ornithodoros moubata . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . A . . . G . G T . .
ACARI Platynothrus peltifer C . T . . T . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . T
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . A . . . . . . C G A . . C
ACARI Varroa destructor . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . .
AMBLYPYGI Phrynus sp. C . T . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . A G . . . . T
ARANEAE Calisoga longitarsis C . . . . . . . A . . G . . . . . A . . A . . A . . C C . A . A .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis C . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A .
ARANEAE Haplopelma huwenum . . . . . C . . A . . A . . C . . A . . A . . . . . A T . A . A .
ARANEAE Habronattus oregonensis . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . A . . . . . A T . A . A G
ARANEAE Nephila clavata C . T . . T . . A . . A . . . . . T . . A . . . . . A G . A . A .
ARANEAE Hypochilus thorelli C . . . . C . . A . . G . . C . . A C . A . . C . . . G . A . A .
OPILIONES Chileogovea oedipus C . . . . . . . A . . C . . . . . T . . A . . A . . . G . . T . T
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . A . . . G . . T T T
PSEUDOSCORPIONES Apochthonius sp . . . . . T . . . . . A . . . . . A C . A . . . . . . G . . T T T
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi . . G . . T . . . . . . . . . A C C C . . . . . . . . G . . T T T
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . G C G A . . A . . . . . T . . . . . . . . A G . . . G .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . . T . . A . . . . . . T C T . . . . . . . . . . . . . . .
SCORPIONES Buthus occidentalis C . T . . . . . A . . . . . C . . A . . A . . C . . A G . A . . C
SCORPIONES Centruroides limpidus C . C . . . . . A . . . . . C . . A . . . . . A . . C G . G . . T
SCORPIONES Mesobuthus gibbosus C C . . . . . . A . . . . . . . . T . . A . . . . . . - - - - - -
SCORPIONES Uroctonus mordax C . C . . . . . A . . A . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . G . . T
UROPYGI Mastigoproctus giganteus . . . . . . . . A . . . . . C . . T . . . . . . . . . G . . . . T
UROPYGI Typopeltis sp . . . . . T . . A . . . . . . . . T . . A . . . . . . G . G . . T
PYCNOGONIDA Ammothea hilgendorfi . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . T . T
PYCNOGONIDA Nymphon sp C . . . . T . . A . . A . . . . . T . . A . . C . . . . . C T . T
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . . . . . . . A . . C . . . . . T . . A . . . . . . . . . T . T
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus C . C . . T . G . . . G . . . . . A . . . . . C . . . . . . T . .
MYRIAPODA Narceus annularis . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . A . . A . . . . . . T . .
MYRIAPODA Scutigera coleopterata . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . C . . A . . . T . T
Drosophila yakuba . . . . . T . . A . . . . . . . . T . . A . . . . . . G . A T . T