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          Large Ribosomal Subunit (16S)

 

          LR-N-12866 (alias 16Sbi). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          LR-J-12887 (alias 16Sbr, 16Sb). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          16SBL Reads as CDS, forward.

          16S-LR1 Reads against CDS, reverse.

          LR-N-12945 (alias Faw16S2). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          LR-N-13176 (alias 16S2). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          LR-J-13331 (alias 16Smid2 reverse). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          LR-J-13375 (alias 16Sc). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          LR-N-13398 (alias 16Sar). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          LR-J-13417 (alias 16Sa). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          16S-UF1 Reads as CDS, forward.

 

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       mt genomes we have evaluated
 

LR-N-12866(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C T T T A C G T G A T T T G A G T T C A G A C C G G C - - - - G T G
LR-N-12866(16sbi)(22 mer) - - - - . . a . . . . c . . . . . . . . a . . . . . - - - - - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae T A G C . . . . . . A C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . .
ACARI Ixodes hexagonus T C C . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . - - - - . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum A A G A . . A . . . G C . . . . . . . . A G T . . A . - - - - . A .
ACARI Ornithodoros moubata T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ACARI Platynothrus peltifer T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . A
ACARI Rhipicephalus sanguineus T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . A - - - - . . C
ACARI Varroa destructor . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . - - - - . . A
AMBLYPYGI Phrynus sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Calisoga longitarsis . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ARANEAE Habronattus oregonensis A A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . A
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Hypochilus thorelli A G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . C A
ARANEAE Nephila clavata . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T C G G C . . A
ARANEAE Ornithoctonus huwena A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
OPILIONES Chileogovea oedipus G A . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
OPILIONES Phalangium opilio T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T A A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . A
RICINULEI Cryptocellus centralis T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . A .
RICINULEI Pseudocellus pearsei T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . .
SCORPIONES Buthus occitanus T . . . C . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
SCORPIONES Centruroides limpidus G . . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . . - - - - . . A
SCORPIONES Uroctonus mordax T C . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
SOLIFUGAE Nothupuga sp . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
THELYPHONIDA Typopeltis sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T - - - - . . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
MYRIAPODA Narceus annularus . C . . . . A . . . . C . . . . . . T . A . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata T . C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata A A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Nymphon gracile T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A

LR-J-12887(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C T T T A C G T G A T T T G A G T T C A G A C C G G C - - - - G T G
LR-J-12887(alias 16Sbr, 16Sb)(rev) - - - - . . . . . . . c . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae T A G C . . . . . . A C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . .
ACARI Ixodes hexagonus T C C . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . - - - - . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum A A G A . . A . . . G C . . . . . . . . A G T . . A . - - - - . A .
ACARI Ornithodoros moubata T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ACARI Platynothrus peltifer T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . A
ACARI Rhipicephalus sanguineus T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . A - - - - . . C
ACARI Varroa destructor . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . - - - - . . A
AMBLYPYGI Phrynus sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Calisoga longitarsis . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ARANEAE Habronattus oregonensis A A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . A
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Hypochilus thorelli A G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . C A
ARANEAE Nephila clavata . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T C G G C . . A
ARANEAE Ornithoctonus huwena A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
OPILIONES Chileogovea oedipus G A . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
OPILIONES Phalangium opilio T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T A A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . A
RICINULEI Cryptocellus centralis T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . A .
RICINULEI Pseudocellus pearsei T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . .
SCORPIONES Buthus occitanus T . . . C . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
SCORPIONES Centruroides limpidus G . . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . . - - - - . . A
SCORPIONES Uroctonus mordax T C . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
SOLIFUGAE Nothupuga sp . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
THELYPHONIDA Typopeltis sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T - - - - . . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
MYRIAPODA Narceus annularus . C . . . . A . . . . C . . . . . . T . A . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata T . C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata A A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Nymphon gracile T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A

16SBL(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C T T T A C G T G A T T T G A G T T C A G A C C G G C - - - - G T G
16SBL(Simple Fool's Guide) - - - - . . . . . . . c . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae T A G C . . . . . . A C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . .
ACARI Ixodes hexagonus T C C . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . - - - - . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum A A G A . . A . . . G C . . . . . . . . A G T . . A . - - - - . A .
ACARI Ornithodoros moubata T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ACARI Platynothrus peltifer T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . A
ACARI Rhipicephalus sanguineus T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . A - - - - . . C
ACARI Varroa destructor . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . - - - - . . A
AMBLYPYGI Phrynus sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Calisoga longitarsis . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ARANEAE Habronattus oregonensis A A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . A
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Hypochilus thorelli A G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . C A
ARANEAE Nephila clavata . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T C G G C . . A
ARANEAE Ornithoctonus huwena A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
OPILIONES Chileogovea oedipus G A . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
OPILIONES Phalangium opilio T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T A A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . A
RICINULEI Cryptocellus centralis T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . A .
RICINULEI Pseudocellus pearsei T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . .
SCORPIONES Buthus occitanus T . . . C . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
SCORPIONES Centruroides limpidus G . . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . . - - - - . . A
SCORPIONES Uroctonus mordax T C . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
SOLIFUGAE Nothupuga sp . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
THELYPHONIDA Typopeltis sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T - - - - . . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
MYRIAPODA Narceus annularus . C . . . . A . . . . C . . . . . . T . A . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata T . C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata A A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Nymphon gracile T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A

16S-LR1(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus C T T T A C G T G A T T T G A G T T C A G A C C G G C - - - - G T G
16S-LR1(MASTA)(rev) - - - - - . . . . . . Y . . . . . . . . R . . . . . - - - - - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae T A G C . . . . . . A C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . .
ACARI Ixodes hexagonus T C C . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . - - - - . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum A A G A . . A . . . G C . . . . . . . . A G T . . A . - - - - . A .
ACARI Ornithodoros moubata T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ACARI Platynothrus peltifer T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . A G T . . . . - - - - . . A
ACARI Rhipicephalus sanguineus T C C . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . A - - - - . . C
ACARI Varroa destructor . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . - - - - . . A
AMBLYPYGI Phrynus sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Calisoga longitarsis . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
ARANEAE Habronattus oregonensis A A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . A
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
ARANEAE Hypochilus thorelli A G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . C A
ARANEAE Nephila clavata . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T C G G C . . A
ARANEAE Ornithoctonus huwena A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
OPILIONES Chileogovea oedipus G A . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
OPILIONES Phalangium opilio T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T A A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . A
RICINULEI Cryptocellus centralis T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . A .
RICINULEI Pseudocellus pearsei T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
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SCORPIONES Buthus occitanus T . . . C . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
SCORPIONES Centruroides limpidus G . . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . T . . . . - - - - . . A
SCORPIONES Uroctonus mordax T C . . C . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
SOLIFUGAE Nothupuga sp . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . - - - - . . .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T - - - - . . A
THELYPHONIDA Typopeltis sp A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T - - - - . . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
MYRIAPODA Narceus annularus . C . . . . A . . . . C . . . . . . T . A . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata T . C . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T - - - - . . .
MYRIAPODA Thyropygus sp T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculta A A . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Nymphon gracile T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . A
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . - - - - . . .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba T C . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . T - - - - . . A

LR-N-12945(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus G T T T G C G A C C T C G A T G T T G A A T T A A A G A G
LR-N-12945(alias Faw16S2)(21mer) - - - - . . . . . . . . . . . . . . . g . . . . . - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae . A . . T . . . . . . . . . . . . . . G T . . G C T T - -
ACARI Ixodes hexagonus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G G A T -
ACARI Leptotrombidium pallidum . A . . A . T . . . . . . . . . . . . G C . . T C T T . -
ACARI Ornithodoros moubata . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G G A T -
ACARI Platynothrus peltifer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A T -
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G G A T -
ACARI Varroa destructor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T A
AMBLYPYGI Phrynus sp T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T T T
ARANEAE Calisoga longitarsis . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T -
ARANEAE Habronattus oregonensis . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . -
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T -
ARANEAE Hypochilus thorelli A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C T . -
ARANEAE Nephila clavata . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . T T
ARANEAE Ornithoctonus huwena . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T -
OPILIONES Chileogovea oedipus . A . . A T T . . . . . . . . . . . . G . . . . . T T . -
OPILIONES Phalangium opilio . A . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T -
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T A A A C . T . . . . . . . . . . . . . . . C T T T T G -
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T
RICINULEI Pseudocellus pearsei . A . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T - - T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp A A . . - . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A T -
SCORPIONES Buthus occitanus . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T
SCORPIONES Centruroides limpidus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G C T T
SCORPIONES Uroctonus mordax . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G A T -
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . T . . A
SOLIFUGAE Nothupuga sp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . T T . . .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus . A . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T -
THELYPHONIDA Typopeltis sp . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T -
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G A T A
MYRIAPODA Narceus annularus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G . . T
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G . A T T
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G A . T
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T T T
PYCNOGONIDA Nymphon gracile . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . G A
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . A . . T . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A T T
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G A T -

LR-N-13176(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus A G G G A C G A G A A G A C C C T A T T A A G C T T - T
LR-N-13176(alias 16S2)(20mer) - - - - . . . . . . . . . . . . . . . g g . . . - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae T A A . . . . . . . . . . . . . . . G A . T T T . - - .
ACARI Ixodes hexagonus . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . T T . . - .
ACARI Leptotrombidium pallidum T T A . . . . . . . . . . . . . C . G G . T C T - - - -
ACARI Ornithodoros moubata T A . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . T T . . - .
ACARI Platynothrus peltifer T A A . . . . . . . . . . . . . C . C A . . C . - - - .
ACARI Rhipicephalus sanguineus . A . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . T T . A - .
ACARI Varroa destructor T T A . . . A . . . . . . . . . . . . G . . T . . . - .
AMBLYPYGI Phrynus sp . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . T . . - .
ARANEAE Calisoga longitarsis . A A . . . . . C . . . . . . . . G A C . . A . . . - -
ARANEAE Habronattus oregonensis . A A . . . . . T . . . . . . . . . . . G . A . . . - -
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . - G
ARANEAE Hypochilus thorelli . A A . . . . . T . . . . . . . . . . . G . A . . . - -
ARANEAE Nephila clavata . A A . . . . . C . . . . . . . . . . . G . A . . . - -
ARANEAE Ornithoctonus huwena G . . . . . . . C . . . . . . . . . . C G . A . . . - -
OPILIONES Chileogovea oedipus . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . - .
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . - .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T T A . . . . . T . . . . . . . . . A A . . T T . . - -
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . G C T . . - G
RICINULEI Pseudocellus pearsei . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . C T . A - -
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . A A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T T . . - -
SCORPIONES Buthus occitanus T T A . . . A . . . . . . . . . . . . A . . A . . . - .
SCORPIONES Centruroides limpidus T T A . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . - .
SCORPIONES Uroctonus mordax . A A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . - .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus G T A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . - G
SOLIFUGAE Nothupuga sp T T A . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . T A
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus T . . . . . . . T . . . . . . . . . . C G . . . . . - .
THELYPHONIDA Typopeltis sp C . . . . . . . T . . . . . . T . G . . G . . . . . - .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIA Lithobius forficatus . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T - . T .
MYRIA Narceus annularus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . - . T G
MYRIA Scutigera coleoptrata . A A . . . A . . . . . . . . . . . . C . . . T - . T .
MYRIA Thyropygus sp T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T - . T .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . A A
PYCNOGONIDA Nymphon gracile . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A G . . T . . - .
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . - .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . A A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . - . T .

LR-J-13331(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T T G - A C C G T G C G - A A G G T A G C A T A A T C A T T T G
LR-J-13331 (alias 16Smid2 reverse)(rev) - - - - . . t . . . . - a . . . . . . . . . . . . . . . - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae . . A - . . T . . . . T - . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
ACARI Ixodes hexagonus . . . - . . T A . A . . - . . . . . . T T G A . . . A . - - - .
ACARI Leptotrombidium pallidum . . T A - . T T C . . A - . . . . . . . . . . . . . A . . . C .
ACARI Ornithodoros moubata A . . - . . T A . A . . - . . . . . . T T G A . . . A . - - - .
ACARI Platynothrus peltifer . . . - . . . A . . . T - . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . - . . T A . A . A - . . . . . . T T G A . . . A . - - - .
ACARI Varroa destructor C . A - . . T A C A . A - . . . . . . T T G A . . . A . - - - .
AMBLYPYGI Phrynus sp . . . - . . T . . . . T - . . . . . . . . . . . . . A . . . A .
ARANEAE Calisoga longitarsis - - - - - T T . . . . T - . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
ARANEAE Habronattus oregonensis - - - - - - T . . . . T - . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . A - . . T . . . . T - . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
ARANEAE Hypochilus thorelli . . A A - . T A . . . T - . . . . . . . . . . . . . A . A . . .
ARANEAE Nephila clavata . . - - - . T . . . . T - . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
ARANEAE Ornithoctonus huwena - - - - - - A . . . . T - . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
OPILIONES Chileogovea oedipus . . - - - . T . . A . T - . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
OPILIONES Phalangium opilio C . . - . . T . . . . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A . T T . . T . . A . . - . . . . . . . . . . G . . A . . A A .
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . - . . T . . . . . - . . . . . . . . G A . . . . . A . . .
RICINULEI Pseudocellus pearsei . . . - . . T . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp C . . - . T T . . . . A - . . . . . . . . G A . . . A . . . . .
SCORPIONES Buthus occitanus . . . - . . T . . A . A - . . . . . . . . . . . . . A . . . A .
SCORPIONES Centruroides limpidus . . . - . . . . . . . A - . . . . . . . . . . . . . A . . . A .
SCORPIONES Uroctonus mordax A . . - . . . . . . . A - . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . - . . T . . . . A - . . . . . . . . . . . . . A . A . . .
SOLIFUGAE Nothupuga sp . . . - . . . . . . . . - . G A . . . . . . . . . . A . A . A .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus . . . - . . T . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
THELYPHONIDA Typopeltis sp . . . - . . T . . . . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . . - . . T . . . . A - . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
MYRIAPODA Narceus annularus . . . - . . T . . A . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . . . - . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
MYRIAPODA Thyropygus sp A . . - . . T . . A . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata . . . - . . T . . . . A - . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
PYCNOGONIDA Nymphon gracile . . . - - - T . . C T - - . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . . - . . T . . . . T - . . . . . . . . . . . . . A . . . A .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . . . - . . T . . . . - A . . . . . . . . . . . . . . . . . A .

LR-J-13375(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus A A A A A T - - C G - G A C C T G C C C A A T G A G - - -
LR-J-13375(alias 16Sc)(rev) - - - - g . - - . t - a . . . . . . t . . c . . . - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae T T . . . . - - G A - T G . . . . . . . T C . . . . - - -
ACARI Ixodes hexagonus . . . . T G - - T A A A . T . . . . T . . . . . . - - - -
ACARI Leptotrombidium pallidum . . T . G A - - A T - C T T . . . . . A G T . . T - - - -
ACARI Ornithodoros moubata . G . T G . - - A . - A . . . . . . T . . . . . . T - - -
ACARI Platynothrus peltifer G T . G G . - - G T - T C . . . . . . . . G . . G - - - T
ACARI Rhipicephalus sanguineus T . . . T G - - . A A A T . . . . . T . . . . . . - - - -
ACARI Varroa destructor . . . . . A - - T A T . T T . . . . T . . . . . C T A - -
AMBLYPYGI Phrynus sp . . . . . . - - . T - A . . . . . . T . . . . . - - - - -
ARANEAE Calisoga longitarsis . C T . G . - - A . - T . . . . . . T . . . . . - - - - A
ARANEAE Habronattus oregonensis . . T . G . - - A A - A . T . . . . T . C . . . - - - - T
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . - - . T - . . . . . . . T . . . . . - - - C A
ARANEAE Hypochilus thorelli . T . . . . - - A T - C T . . . . . T . . . . . - - - - -
ARANEAE Nephila clavata . T T . G . - - A A - A . . . . . . T . C . . . - - - - T
ARANEAE Ornithoctonus huwena T T T . G . - - A A - . . . . . . . T . . . . . - - - - A
OPILIONES Chileogovea oedipus T . . . . G - - T A T C T T . . . . T . C . . . . T A - -
OPILIONES Phalangium opilio T . . . . . - - A A - . C . . . . . T . T . . . . T A T T
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi T . . G . . - - T A - A T T . . . . . . T . . . C A - - -
RICINULEI Cryptocellus centralis T . . . . . - - . T - T T . . . . . . . . . C . . T A A G
RICINULEI Pseudocellus pearsei T - . . . . - - . T - . . T . . . . . A . T . . . T T A G
SCHIZOMIDA Hubbardia sp T . . . . A - - A A - T C T . . . . A . T . A T G A A - -
SCORPIONES Buthus occitanus T . . . G . - - . T - . C T . . . . . . . . . . C - - - -
SCORPIONES Centruroides limpidus . . . . . . - - G A - . T . . . . . T . . . . . T - - - -
SCORPIONES Uroctonus mordax . . . . . . - - . . - A . . . . . . T . . . . . T T - - -
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . G G G . - - . T - T T T . . . . T . . . . . . T - - -
SOLIFUGAE Nothupuga sp . . G G T A - - - T - T G . . . . . T . . G . . T T G T -
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus . . . . G . - - . T - . G . . . . . T . . C . . . T - - -
THELYPHONIDA Typopeltis sp . . G . G . - - T A - . G . . . . . T . . C . . . T - - -
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . G . . . - - A A - . G T . . . . . . . . . . . - T T -
MYRIAPODA Narceus annularus G . G . . . - - . T - . G . . . . . . . . C . . . A T T -
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . G . . . . - - . T - . . . . . . . . . . . . . . . G T -
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . . - - . A - . G . . . . . . . G C . . . T A G -
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata . T . G G . C G A A - - - . . . . . . . . . . . . T - A G
PYCNOGONIDA Nymphon gracile T . . . G . - A T A - . T . - . . . . . . G . . . T - - A
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T T T . . G T - . T - A . . . . . . T . . . . . . T T A -
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba T . . . G . - - . T - A . . . . . . . . . C . . . A A A -

LR-N-13398(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T T T T C G - C C T G T T T A T C A A A A A C A - T G - G T
LR-N-13398(alias16Sar)(20mer) - - - - . . - . . . . . . . . a . . . . . . . . - . - - - -
ACARI Dinothrombium pandorae G C . C . . - A A . . . . . . . . . . . . T . T - . T - T .
ACARI Ixodes hexagonus . G A . T . - A . . . . . . . A . . . . . . . . - . T - T C
ACARI Leptotrombidium pallidum . . . . T . - A A . . . . . . . . . . . . T . T - . T - T C
ACARI Ornithodoros moubata - . - . G . - A A . . . . . . . . . . . . . . . - . T - . .
ACARI Platynothrus peltifer - C G . A A - A T . . . . . . . . . . . . T . T - A A - T C
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . C T . - A . . . . . . . A T . . . . . . . - A C - . C
ACARI Varroa destructor . A . . . A - A . . . . . . . A . . . . . . . . - . T - T .
AMBLYPYGI Phrynus sp C . C C . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . - . .
ARANEAE Calisoga longitarsis C A A . T . - A . . . . . . . . . . . . . . . . - . A - . C
ARANEAE Habronattus oregonensis - G A A T . - A . . . . . . . . . . . . . . . . - . T - T C
ARANEAE Heptathela hangzhouensis C . C - - . - . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . - . .
ARANEAE Hypochilus thorelli . . A . . . - A . A . . . . . A . . . . . . . . - A T - T .
ARANEAE Nephila clavata - - A A T . - A . . . . . . . C . . . . G . . . - . T - T C
ARANEAE Ornithoctonus huwena C . - - - . - A . . . . . . . C . . . . . . . . - . T - T C
OPILIONES Chileogovea oedipus A . A . T A - A . . . . . . . . . . . . . . . . - . T T C .
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . . - A . . . . . . . . . . . . . . . . - . T - T .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A . A G T T - T A A . . . . . . . . . . . . . . - . A - . .
RICINULEI Cryptocellus centralis . A . . T C - T A . . . . . . . . . . . . . . . - . . - . .
RICINULEI Pseudocellus pearsei . . . A T . - . A . . . . . . . . . . . . G . T - . . G T .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . C A A - A A . . . . . . A . . . . G T . T - . T - T .
SCORPIONES Buthus occitanus . C . . G . - A A A . . . . . A . . . . . . . . - . A - T C
SCORPIONES Centruroides limpidus . . C . G . - T . . . . . . . . . . . . . . . . - . A - T .
SCORPIONES Uroctonus mordax A . . . A . - . . . . . . . . C . . . . . . . . - . . - . .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . G . C . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . - . C
SOLIFUGAE Nothupuga sp . A . . . A A - . . . . . . . A . . . . . . . . T . T - C C
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus . A . . . A - . . . . . . . . C . . . . . . . . - . . - . C
THELYPHONIDA Typopeltis sp . G . . T A - . . . . . . . . C . . . . . . . . - . . - .