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          Small Ribosomal Subunit (12S)

 

          SR-J-14233 (alias 12Sbi). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          12S-LR1 Reads against CDS, reverse.

          SR-N-14275 (alias 12Sc). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          SR-J-14508 (alias 12Sj). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          SR-N-14522 (alias 12Se). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          SR-N-14588 (alias 12Sai). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          SR-J-14612 (alias 12Sair). Simon et al. 1994. Reads against CDS, reverse.

          12S-UF1 Reads as CDS, forward.

          SR-N-14756 (alias 12Sh). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

          SR-N-14922 (alias 12Sgi). Simon et al. 1994. Reads as CDS, forward.

 

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      mt genomes we have evaluated
 

SR-J-14233(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus A T G T A C A C A T C - G C C C G T C G C T C T C G C T -
SR-J-14233(alias 12Sbi)(rev) - - - - . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . t - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A T . . . G . T G A
ACARI Ixodes hexagonus . . . C . . . T . . . - . . . . . . . . . . . . . A A . -
ACARI Leptotrombidium pallidum . . . . . . . T . . . - . . . . . . . . T C . . - - - - A
ACARI Ornithodoros moubata . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . A G . G
ACARI Platynothrus peltifer . A . . . . . T . . . - . . . . . . . A T . . . - - T G -
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T T T A -
ACARI Varroa destructor G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . T . . A G . -
AMBLYPYGI Phrynus sp . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T . T . -
ARANEAE Calisoga longitarsis G . . . . . . T . . . - . . . . . . . . . C . . . . T C -
ARANEAE Habronattus oregonensis G . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . C . . T A T . -
ARANEAE Heptathela hangzhouensis - . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . A T . A
ARANEAE Hypochilus thorelli G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A T C . . T A T C -
ARANEAE Nephila clavata G . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . C . . T T . C -
ARANEAE Ornithoctonus huwena G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . C . . . . T C -
OPILIONES Chileogovea oedipus - . . C . . . T . . T - . . . . . . . . . . . . T A T . A
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . G . T . -
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi - . . . T . . T . . . - . . . . . . . A A . T . T T . . T
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T . A . G
RICINULEI Pseudocellus pearsei . . . . . . . T . . . G C . . G . . . . . . . . . A A A T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . . . . T . . . - . . . . . . . . . . . A A A . - -
SCORPIONES Buthus occitanus . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . T T . T
SCORPIONES Centruroides limpiduus . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . T . . T
SCORPIONES Uroctonus mordax . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T T . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . C . T . . . . . - . . . . . . . . . . . C . A T . T
SOLIFUGAE Nothopuga sp . . . C . T . . . . . - . . . . . . . . . . T . . A T . T
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus . . . . . . . T . . . - . . . . . . . . . . . . T . T . -
THELYPHONIDA Typopeltis sp G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T . T . G
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus G . . . . . . . . . . - . . . . . . . A . . . . . A T . -
MYRIAPODA Narceus annularus . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A T . . . T . T C -
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata - . . C . . . . . . . - . . . . . . . A . . . . . A T G -
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . . . . . . . - . . . . . . . A . . . . . A T A -
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata . . . . . . . T . . T - . . . . . . . . . . . . . . T . G
PYCNOGONIDA Nymphon gracile G . . . . . . A . . . - . . . . . A T . . . . C . T . . G
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . A . . . . . T . . T - . . . . . . . . . . . . . A T . A
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . T A T . -

12S-LR1(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus A T G T A C A C A T C - G C C C G T C G C T C T C G C T -
12S-LR1(MASTA)(rev) - - - - . . . Y . . . - . . . . . . . R . . . . - - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A T . . . G . T G A
ACARI Ixodes hexagonus . . . C . . . T . . . - . . . . . . . . . . . . . A A . -
ACARI Leptotrombidium pallidum . . . . . . . T . . . - . . . . . . . . T C . . - - - - A
ACARI Ornithodoros moubata . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . A G . G
ACARI Platynothrus peltifer . A . . . . . T . . . - . . . . . . . A T . . . - - T G -
ACARI Rhipicephalus sanguineus . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T T T A -
ACARI Varroa destructor G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . T . . A G . -
AMBLYPYGI Phrynus sp . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T . T . -
ARANEAE Calisoga longitarsis G . . . . . . T . . . - . . . . . . . . . C . . . . T C -
ARANEAE Habronattus oregonensis G . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . C . . T A T . -
ARANEAE Heptathela hangzhouensis - . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . A T . A
ARANEAE Hypochilus thorelli G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A T C . . T A T C -
ARANEAE Nephila clavata G . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . C . . T T . C -
ARANEAE Ornithoctonus huwena G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . C . . . . T C -
OPILIONES Chileogovea oedipus - . . C . . . T . . T - . . . . . . . . . . . . T A T . A
OPILIONES Phalangium opilio . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . G . T . -
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi - . . . T . . T . . . - . . . . . . . A A . T . T T . . T
RICINULEI Cryptocellus centralis . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T . A . G
RICINULEI Pseudocellus pearsei . . . . . . . T . . . G C . . G . . . . . . . . . A A A T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . . . . T . . . - . . . . . . . . . . . A A A . - -
SCORPIONES Buthus occitanus . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . T T . T
SCORPIONES Centruroides limpiduus . . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . . T . . T
SCORPIONES Uroctonus mordax . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T T . . A
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . . . C . T . . . . . - . . . . . . . . . . . C . A T . T
SOLIFUGAE Nothopuga sp . . . C . T . . . . . - . . . . . . . . . . T . . A T . T
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus . . . . . . . T . . . - . . . . . . . . . . . . T . T . -
THELYPHONIDA Typopeltis sp G . . . . . . T . . . - . . . . . . . A . . . . T . T . G
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus G . . . . . . . . . . - . . . . . . . A . . . . . A T . -
MYRIAPODA Narceus annularus . . . C . . . T . . . - . . . . . . . A T . . . T . T C -
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata - . . C . . . . . . . - . . . . . . . A . . . . . A T G -
MYRIAPODA Thyropygus sp . . . . . . . . . . . - . . . . . . . A . . . . . A T A -
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata . . . . . . . T . . T - . . . . . . . . . . . . . . T . G
PYCNOGONIDA Nymphon gracile G . . . . . . A . . . - . . . . . A T . . . . C . T . . G
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . A . . . . . T . . T - . . . . . . . . . . . . . A T . A
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . . . . . . . . . . . - . . . . . . . . . . . . T A T . -

SR-N-14275(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus - T T G A A G G T G G A T T T G A - A A G T A A T T T T T
SR-N-14275(alias 12Sc) - - - - . . . . . . . . . . . . g - t . . . . . a - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae - - - C . G T T A . . . C . . A . - . . . . . . - . . C .
ACARI Ixodes hexagonus - - G A G . T T A . . . . . . A . - . . . . . . A . . A .
ACARI Leptotrombidium pallidum - - - T . . T A A . . . C C . . . - . . . . . . A A . . .
ACARI Ornithodoros moubata - - G . G T T T A . . . . . . A . - . . . . . . A . . . G
ACARI Platynothrus peltifer - - - - - G T T A . T . - - - A . - - - . . T . - . . . .
ACARI Rhipicephalus sanguineus - - A C . T T T A . . . . . . . . - . . . . . . A A . . G
ACARI Varroa destructor - A . A . . . A A A . . . . . A . - . . . . . . A A . A .
AMBLYPYGI Phrynus sp - . . . . . . . . . . . . . . A . - . T . . . . . . . A G
ARANEAE Calisoga longitarsis - C - . . . T T A A . . . . . A . - . . . . . T . . . C A
ARANEAE Habronattus oregonensis - - A . . . A A A . . . . . . A T - . . . . . T A A A C .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis - - . A . . A C A . . . . . . A . - . . . . . . A . A . A
ARANEAE Hypochilus thorelli - - A T . . A . A . . . . C . A T - . . . . . T . . . C .
ARANEAE Nephila clavata T - A C . . A A A . . . . . . A T T - . . . . . . A . . .
ARANEAE Ornithoctonus huwena - A G A G T C A A . . . . . . A . - T . . . . . . A A A .
OPILIONES Chileogovea oedipus - A . . . . A T . . . . . . . A T - T T . . . . - - . - -
OPILIONES Phalangium opilio T A . A . . A A . . . . . . . . C - T . . . . . A . . A A
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi - - G A G . - . A . A . C . . . T - T . . . . . . A . A .
RICINULEI Cryptocellus centralis - A . . . T A A . . . . . . . . . - T . . . . . - . . A .
RICINULEI Pseudocellus pearsei - - . . . G A T . . . . . . . A . - T . . . . . - G G A A
SCHIZOMIDA Hubbardia sp T . C A . . . . . . . . . . A . G - G T . . . . G A . A A
SCORPIONES Buthus occitanus - . . . . . A . . . . . . . . . G - . . . . . G G . . G A
SCORPIONES Centruroides limpiduus - - . . . . . . . . . . . . . A . - . . . . . T . . . . A
SCORPIONES Uroctonus mordax - . G C . . A . A . . . . . C A . - . . . . . . . . . A G
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus - - . . . . . . . . . . . . . A . - . . . . . . . . G G G
SOLIFUGAE Nothopuga sp - - . . . . . . . . . . . . . A T - G . . . . . . A . . G
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus A . . . . . A . . . . . . . . A . - C . . . . . . . . . G
THELYPHONIDA Typopeltis sp A - A . . . A . . . . . . . . A G - T . . . . . . . A . G
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus T . . . . . . T . . . . . . . A G - T T . . - . . A A A .
MYRIAPODA Narceus annularus - - A T . . . . . . . . . . . A T - T T . . . . G . G . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata - . . . . . . . . . . . . . . A . - T T . . - . A . A A G
MYRIAPODA Thyropygus sp - - . . . . . . . . . . . . . A T - T . . . . . A . . . .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata - - - - . . . . A . . . . . . A G - . . . . . . A A A . .
PYCNOGONIDA Nymphon gracile - - - A . . - T . . A . C . . A . - . . . . . . A . . G A
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare - - . A . . . . . . . . . . . A . - . . . . . . . . - . .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba T . . . . . . . . . . . . . . . G - T . . . . . A A . . A

SR-J-14508(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus - G T T C A G A G G A A T - - C T G C T C - - T G - - T A A T - C
SR-J-14508(alias 12Sj)(rev) - - - - . . . . . . . . . - - . . . t . t - - . . - - . . - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae A - G . T . . G . . G G . - - T . . . . T - - . T - - . . . A T T
ACARI Ixodes hexagonus - T . . T . . . . . . . . - - T . . . . . - - . . - - . . . . - G
ACARI Leptotrombidium pallidum C - - . . . . G . . . . . - - T . . . C T - - A A - - . . . A T .
ACARI Ornithodoros moubata - A . . T . . . . . . . . - - T . A T . . - - . T - - . . . . - G
ACARI Platynothrus peltifer A - G A . . . . . . . G C - - T . . . A T G - . T - - - - . A A A
ACARI Rhipicephalus sanguineus - T . . . . . . . . . . . - - T . . T . . - - . T - - . . . . - G
ACARI Varroa destructor - T A . T . . . . . . . . - - T . . T A A - - A . - - . . . G - G
AMBLYPYGI Phrynus sp - . . . T . . . . . . . C - - . . . T C . - - . . - - . . . . - T
ARANEAE Calisoga longitarsis - - - . T . A . . . . . C - - T . . T . G T - - T - - . G . . C -
ARANEAE Habronattus oregonensis - - - . T . . . . . . . C - - T . . T . G - - . A - - . . . . - .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis - - - . T . . . . . . G . - - T . . T A G - - . . - - . . . . - .
ARANEAE Hypochilus thorelli - - - A T . . . . . . . C - - T . . T A T - - . T - - . . . . T .
ARANEAE Nephila clavata - - - . T . . . . . . . C - - . . . . . A A - - A - - . . . . - .
ARANEAE Ornithoctonus huwena - - - . T . . . . . . . C - - T C . T A T - - C T - - . . . . C .
OPILIONES Chileogovea oedipus - A A . T . . . . . . . . - - . . . T . . - - . A - - . . . . - G
OPILIONES Phalangium opilio A A - G . . . . . . . . C - - T . . . C . - - . T T A A T - . G A
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi - - - - T . . G . . G G . - - T . A T C . T - . T - - A . . A - -
RICINULEI Cryptocellus centralis - T A . . . . . . . . . C - - T . . T . . - - . . - - . . . . - .
RICINULEI Pseudocellus pearsei - T A . T . . . . . . . . - - T . . T . . - - . . - - . . . . - .
SCHIZOMIDA Hubbardia sp T A . . . T . . . . . . C - - T . . T . T G A . . - - G . . G T A
SCORPIONES Buthus occitanus - - A . . . . . . . . . C - - T . . . G T - - . T - - . . . C T .
SCORPIONES Centruroides limpiduus - - A . T . . . . . . . C - - . . . T . T - - . T - - . . . - T .
SCORPIONES Uroctonus mordax - - - . T G . . . . . . C - - . . . T . G - - . T - - . . . . - T
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus - - G . T . . . . . . . C - - . . . T C . - - A T - - . G . . - .
SOLIFUGAE Nothopuga sp - - - . T . . . . . . . C - - . . . T . . - - . . - - . G . . - .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus - - - . T . . . . . . . C - - T . . T C . - - . A - - . . . . - T
THELYPHONIDA Typopeltis sp - - - C T . . . . . . . C - - T . . T C . - - . T - - . . . . - T
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus A T - C T . . . . . . . . - - . . . T A T - - . T - - . . - A T .
MYRIAPODA Narceus annularus T . - G T . . . . . . . C - - T . . T . . - - . . - - . . - A T .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata A T - . T . . . . . . . C - - . . . T C . - - . . - - . . - A T .
MYRIAPODA Thyropygus sp A A - . T . . . . . . . C - - T . . . C . - - . . - - . . - A T .
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata T A . C T . . . . . . . . - - T . . T . A T G . A - - - . . . - -
PYCNOGONIDA Nymphon gracile T - - . T . . G . . . T G G T T . . T . T T T . A A G . T C G A T
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T - C . T . . . . . . . C - - T . . T C A - - . A - - . . . . - A
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba A T - C . . . . . . . . C - - . . . T . T - - . . - - . . - A T .

SR-N-14522(back)

XIPHOSURA Limulus polyphemus T G A A A C C T - A A A - A A A T T - T G G C G G T G - - C
SR-N-14522(alias 12Se) - - - - . t t c - . . . - g . . . . - . . . . . . . - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae G . . . . . . C G . T T G - - - A . T . . . . . . . T - - T
ACARI Ixodes hexagonus . . . . . T . A T . . G A - - - . . T . . . . . . . A - - T
ACARI Leptotrombidium pallidum . A . . . . . . A . . . G - - - . . T . . . . . . . T - - T
ACARI Ornithodoros moubata . . . . . T . . A . . G A - - - . . A . . . . . . . A - - T
ACARI Platynothrus peltifer . T . . . . . . - C . . C T - - A . T . . . . . . . T C - T
ACARI Rhipicephalus sanguineus C . . . . G . A A . . . A - - - . . A . . . . . . . A - - T
ACARI Varroa destructor . . . . . T T A A . G T C - - - A A A . . . . . . C A - - T
AMBLYPYGI Phrynus sp . . . . . . T . A . . . T - - - . . T . . . . . . . T - - T
ARANEAE Calisoga longitarsis G T C . . . . C - . T C C C . - - . T . . . . . . C C - - T
ARANEAE Habronattus oregonensis . A . . . . . . A . T T A T . - A A A . . . . . . C T - - T
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . . . . . . . . A . . T G - - - G . T . . . . . . . T - - T
ARANEAE Hypochilus thorelli A T . . . . T A A T G . A - - - . . A . . A . . . C A - - .
ARANEAE Nephila clavata C A . . . . T . - . T G T . - - G . T . . . . . . C A - - T
ARANEAE Ornithoctonus huwena G A . . . . . C A T G C C - - - C . T . . . . . . C C - - T
OPILIONES Chileogovea oedipus A A T . . G T A - . . . - . . . A . - . . . . . . . T - - T
OPILIONES Phalangium opilio . A . . - A T . - . . . - . . T . . - . . . . . . . . - - T
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A T . . . . T . - . . G - T T T . A - . . . . . . . A - - .
RICINULEI Cryptocellus centralis A . . . . . T . - . . . A T T - A . T . . . . . . . T - - T
RICINULEI Pseudocellus pearsei . . . . . T . . G . G G G T T - - - T . . . . . . . T - - -
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . . . . G T . . A . G . G - - - A A T . . . . . . . . - - A
SCORPIONES Buthus occitanus . . . . . . T . A . . G A - - - A . T . . . . . . . A - - T
SCORPIONES Centruroides limpiduus . A . . . . T . A . . . A - - - A . T . . . . . . . . - - T
SCORPIONES Uroctonus mordax C . . . . . . . A . . G A - - - A . T . . . . . . . A - - T
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus . A - . . T T . - . . G A G - - A . T . . . . . . . A - - T
SOLIFUGAE Nothopuga sp G A - . . T T . - . . . G G - - A . T . . . . . . . A - - T
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus . . . . . T T . A . . T A - - - . A T . . . . . . . A - - .
THELYPHONIDA Typopeltis sp . . . . . . T . A . T . A - - - . A T . . . . . . C A - - T
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus . . . . . . T . - . . . G . - - G C T . . . . . . C . - - T
MYRIAPODA Narceus annularus . . . . C T T . - . . T G . - - A . T . . . . . . . A - - T
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . . . . . . T . - . . . G . - - A . T . . . . . . . A - - T
MYRIAPODA Thyropygus sp A . . . . T T . - . . G G G - - A . T . . . . . . . A - - T
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata . . . . . T T . - . . . A . - - A . T . . . . . . . A - - A
PYCNOGONIDA Nymphon gracile A A T . . . . A A . G G A - - - A G T . . . . . . . A - G T
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare A T . . . . T . - . . . T . - - A . T . . . . . . . A - - A
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba . . . . . . T . - . . . - . . . . . - . . . . . . . A - - T

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XIPHOSURA Limulus polyphemus T A - T A G - A C C A G G A T T A G A T A C C C T G T T A T T T T A
SR-N-14588(alias 12Sai) - - - - . a - . . t . . . . . . . . . . . . . . . a . . . . - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae - . T - G . - . . T G . . . . . . . . . . . . . C A . . . C . . G T
ACARI Ixodes hexagonus - T T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum - . - - G A - . A A . . . . . . . . . . . . . . . T C C . C . . . T
ACARI Ornithodoros moubata - - T - . A - . T T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C A .
ACARI Platynothrus peltifer A . T G G A - C . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . G . T
ACARI Rhipicephalus sanguineus - T T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A .
ACARI Varroa destructor - . T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A C . T
AMBLYPYGI Phrynus sp - G A - . . - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . .
ARANEAE Calisoga longitarsis - T A - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . C A C . . . . C . C
ARANEAE Habronattus oregonensis A - - - . A - . A T . . . . . . . . . A . . . . . A G . . . A C . .
ARANEAE Heptathela hangzhouensis . T A - T . - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A A A . T
ARANEAE Hypochilus thorelli A T - - . A - . . T . . . . . . . . . G . . . . . A . . . . A G . C
ARANEAE Nephila clavata . - - - . A - . T A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . C T
ARANEAE Ornithoctonus huwena . . A - . . - . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . .
OPILIONES Chileogovea oedipus - . T - . A - . A T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A A A T
OPILIONES Phalangium opilio . . - A . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A . C A . T A . A A G . . . . . . . . . . . . . C T G . . A . G A .
RICINULEI Cryptocellus centralis G - - - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . T
RICINULEI Pseudocellus pearsei A G A G - A - - . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G C T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . G T - . . - . . T T . . . . . . . . . . . . . A A . . . . A C . .
SCORPIONES Buthus occitanus - T A - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . T
SCORPIONES Centruroides limpiduus - T - - . . - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A .
SCORPIONES Uroctonus mordax - . - - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G A .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus - T - A . . - . T T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . G C A .
SOLIFUGAE Nothopuga sp A T - A . A - . - T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A C G .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus - . T - . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A A .
THELYPHONIDA Typopeltis sp G - - - . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus A - - . . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
MYRIAPODA Narceus annularus - - - . . C - . . . T . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . C . .
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata . - - . . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
MYRIAPODA Thyropygus sp G C - . . A - . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata A - - . . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . .
PYCNOGONIDA Nymphon gracile A T T - - A - . A T . . . . . . . . . G . . . . . A G . . . . C . T
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare - - - . . A - . A T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A . A T
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba A . - A . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A .

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SR-J-14612(12Sair)(rev) - - - - . a - . . t . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae - . T - G . - . . T G . . . . . . . . . . . . . C A . . . C . . G T
ACARI Ixodes hexagonus - T T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum - . - - G A - . A A . . . . . . . . . . . . . . . T C C . C . . . T
ACARI Ornithodoros moubata - - T - . A - . T T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C A .
ACARI Platynothrus peltifer A . T G G A - C . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . G . T
ACARI Rhipicephalus sanguineus - T T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A .
ACARI Varroa destructor - . T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A C . T
AMBLYPYGI Phrynus sp - G A - . . - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . .
ARANEAE Calisoga longitarsis - T A - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . C A C . . . . C . C
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ARANEAE Heptathela hangzhouensis . T A - T . - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A A A . T
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ARANEAE Nephila clavata . - - - . A - . T A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . C T
ARANEAE Ornithoctonus huwena . . A - . . - . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . .
OPILIONES Chileogovea oedipus - . T - . A - . A T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A A A T
OPILIONES Phalangium opilio . . - A . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A . C A . T A . A A G . . . . . . . . . . . . . C T G . . A . G A .
RICINULEI Cryptocellus centralis G - - - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . T
RICINULEI Pseudocellus pearsei A G A G - A - - . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G C T
SCHIZOMIDA Hubbardia sp . G T - . . - . . T T . . . . . . . . . . . . . A A . . . . A C . .
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SCORPIONES Uroctonus mordax - . - - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G A .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus - T - A . . - . T T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . G C A .
SOLIFUGAE Nothopuga sp A T - A . A - . - T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A C G .
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus - . T - . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A A .
THELYPHONIDA Typopeltis sp G - - - . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus A - - . . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
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PYCNOGONIDA Nymphon gracile A T T - - A - . A T . . . . . . . . . G . . . . . A G . . . . C . T
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Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba A . - A . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A .

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12S-UF1(MASTA) - - - - . R - . . t . . . . . . . . . . . . . . . - - - - - - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae - . T - G . - . . T G . . . . . . . . . . . . . C A . . . C . . G T
ACARI Ixodes hexagonus - T T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum - . - - G A - . A A . . . . . . . . . . . . . . . T C C . C . . . T
ACARI Ornithodoros moubata - - T - . A - . T T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C A .
ACARI Platynothrus peltifer A . T G G A - C . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . G . T
ACARI Rhipicephalus sanguineus - T T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A .
ACARI Varroa destructor - . T - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A C . T
AMBLYPYGI Phrynus sp - G A - . . - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . .
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OPILIONES Chileogovea oedipus - . T - . A - . A T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A A A T
OPILIONES Phalangium opilio . . - A . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . .
PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi A . C A . T A . A A G . . . . . . . . . . . . . C T G . . A . G A .
RICINULEI Cryptocellus centralis G - - - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . T
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SCORPIONES Uroctonus mordax - . - - . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G A .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus - T - A . . - . T T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . G C A .
SOLIFUGAE Nothopuga sp A T - A . A - . - T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A C G .
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Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus A - - . . A - . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
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Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba A . - A . A - . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A .

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SR-N-14756(alias 12Sh) - - - - . a c a . - . . t . c . . . . . . . . a g t - - - -
ACARI: Dinothrombium pandorae C T T - - T C - C A . T G G C . . . . . . . . A G T T . . .
ACARI Ixodes hexagonus - T G - - . C - G A . . C . . . . . . . . . . C G . . . . .
ACARI Leptotrombidium pallidum C T C - - T C - . A . T G G C . . . . . . . . A G T . T . .
ACARI Ornithodoros moubata - - - - - . C - G A . G C . G - . . . . . . . C G . . . . .
ACARI Platynothrus peltifer T A A - - T . - - A . G G . . . . . . . . . . A T T T . . .
ACARI Rhipicephalus sanguineus - T A - - . C - T A . . T . . . . . . . . . . A G . A . . .
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AMBLYPYGI Phrynus sp - A G - - . . - T A . G . G C . . . . . . . . . . . . . . .
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ARANEAE Hypochilus thorelli - A G - - . C - T A . T . A C . . . . . . . . A G . . . . .
ARANEAE Nephila clavata A C T - - A A - C T . T T . A . . . . . . . . A G T T . . .
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PSEUDOSCORPIONES Pseudogarypus banksi C T A - - . . - . A . T T . A . . . . . . . . A G . T . . .
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THELYPHONIDA Typopeltis sp T T T - - A C - T A . T T . . . . . . . . . . A G T A . . .
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus G A G - - T C . . - . G G . . . . . . . . . . A G A . . . .
MYRIAPODA Narceus annularus T C A - - A C C . - . G C . . . . . . . . . . A G T T . T .
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PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare T T G - - . . . . - . . T . . . . . . . . . . A T . . . . .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba - - - - . A C C . - . . T . G . . . . . . . . A G T . . . .

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SR-N-14922(alias 12Sgi) - - - - a . g t t - t t . - - t t . - t - g g c . . - . - - -
ACARI Dinothrombium pandorae - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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SCORPIONES Buthus occitanus . T - - A G G . G G A . . - - A . . A . G G A - G A A G G A A
SCORPIONES Centruroides limpidus - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
SCORPIONES Uroctonus mordax . C - - A T G G G T A T G - - T . G . . . . A - . . T . A A .
SOLIFUGAE Eremobates palpisetulosus - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
SOLIFUGAE Nothopuga sp - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
THELYPHONIDA Mastigoproctus giganteus A . - - A . G G G G . . T - - T . . . C . . A - . G A . . A .
THELYPHONIDA Typopeltis sp A C - - A T . . C G T . C - - T C A . . C T A - C G A . . A A
Outgroups - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Lithobius forficatus - - - - - T T T C T A G T - - T T A C T G T C - A . A G . G A
MYRIAPODA Narceus annularus C T - - . C T T C C T C T - - T T . A . . G . - . . T T A . A
MYRIAPODA Scutigera coleoptrata - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
MYRIAPODA Thyropygus sp G C - - . . T T . . A C T - - T T . A T . . . - . . A T A . A
PYCNOGONIDA Achelia bituberculata - . T G . . . . T G T T T - - A . . A - . T . A . A T . G . .
PYCNOGONIDA Nymphon gracile - - - - - - - - - - - - - - - - - . - - . . . - A . - - - . .
PYCNOGONIDA Tanystylum orbiculare . . T - . . . . T . T T . - - A . . - - . . . - A - - . G . .
Reference Genome - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Drosophila yakuba - - - - A . G T T - T T . - - T T . - T - G G C . . - . - - -